62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6060 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  905    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  53.27 
 
 		 478 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  52.16 
 
 		 478 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  50.72 
 
 		 485 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.06 
 
 		 481 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  41.38 
 
 		 499 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  36.87 
 
 		 482 aa  252  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  33.41 
 
 		 474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 523 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  33.41 
 
 		 467 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  33.92 
 
 		 466 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  33.48 
 
 		 467 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  31.9 
 
 		 471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  33.73 
 
 		 474 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  28.73 
 
 		 455 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.81 
 
 		 475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  32.88 
 
 		 471 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  31.64 
 
 		 445 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.64 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  31.58 
 
 		 470 aa  176  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.41 
 
 		 460 aa  176  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.41 
 
 		 460 aa  176  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  32.2 
 
 		 462 aa  176  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  32.18 
 
 		 473 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  30.86 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  31.41 
 
 		 444 aa  173  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  32.64 
 
 		 460 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  32.09 
 
 		 455 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  31.11 
 
 		 465 aa  169  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  32.06 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  30.49 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  29.64 
 
 		 469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  30.79 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  30.79 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  30.79 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  30.79 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  30.79 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  30.79 
 
 		 466 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  31.64 
 
 		 464 aa  161  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  28.51 
 
 		 456 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.21 
 
 		 443 aa  156  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  28.09 
 
 		 453 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  31.45 
 
 		 473 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 		 445 aa  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.42 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.08 
 
 		 468 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  31.8 
 
 		 1751 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  24.32 
 
 		 479 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.06 
 
 		 883 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  22.66 
 
 		 506 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  23.52 
 
 		 466 aa  97.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  22.47 
 
 		 468 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  24.91 
 
 		 458 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  23.13 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  29.97 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  29.95 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  25.56 
 
 		 633 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 479 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1425  L-ornithine 5-monooxygenase oxidoreductase protein  23.6 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.901724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4333  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.36 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00887527  normal  0.273636 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  26.71 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>