103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4370 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  54.3 
 
 		 2732 aa  2993    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  36.93 
 
 		 2932 aa  1707    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  38.43 
 
 		 2859 aa  1774    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  48.16 
 
 		 2769 aa  1434    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  37.99 
 
 		 2905 aa  1772    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  41.82 
 
 		 2748 aa  1117    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  36.73 
 
 		 2793 aa  1646    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  44.31 
 
 		 2901 aa  2264    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  43.97 
 
 		 2868 aa  2258    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  44.2 
 
 		 2845 aa  2286    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  43.19 
 
 		 2868 aa  2180    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  43.48 
 
 		 2831 aa  2181    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  44.37 
 
 		 2779 aa  2232    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  39.36 
 
 		 2731 aa  1070    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  47.43 
 
 		 2884 aa  2768    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  37.13 
 
 		 2922 aa  1885    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  36.48 
 
 		 2860 aa  1721    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  44.76 
 
 		 2761 aa  2142    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  44.77 
 
 		 2842 aa  2308    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  40.46 
 
 		 3021 aa  1119    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  53.88 
 
 		 2864 aa  3068    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  38.96 
 
 		 2864 aa  1853    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  39.23 
 
 		 1303 aa  889    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  66.87 
 
 		 2870 aa  3961    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  54.12 
 
 		 2888 aa  3085    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  42.36 
 
 		 2748 aa  1181    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  38.73 
 
 		 2864 aa  1847    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  37.46 
 
 		 2880 aa  1783    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  36.41 
 
 		 2887 aa  1899    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  37.64 
 
 		 2881 aa  1768    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  43.48 
 
 		 2874 aa  2143    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  43.08 
 
 		 2875 aa  2181    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  41.94 
 
 		 2747 aa  1169    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  68.15 
 
 		 2839 aa  4033    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  39.18 
 
 		 2929 aa  1179    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  41.77 
 
 		 2758 aa  1134    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  36.61 
 
 		 2823 aa  1785    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  100 
 
 		 2833 aa  5824    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  39.51 
 
 		 2730 aa  1050    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  68.18 
 
 		 2839 aa  4049    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  37.25 
 
 		 2916 aa  1761    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  38.12 
 
 		 2716 aa  1001    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  35.02 
 
 		 2786 aa  1631    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  36.96 
 
 		 2453 aa  632  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  45.38 
 
 		 624 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  37.72 
 
 		 849 aa  486  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  35.23 
 
 		 786 aa  482  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  29.5 
 
 		 819 aa  318  7e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  28.57 
 
 		 813 aa  308  7e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  28.57 
 
 		 813 aa  308  7e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  28.11 
 
 		 790 aa  303  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  29.7 
 
 		 815 aa  303  4e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  27.73 
 
 		 784 aa  301  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  27.58 
 
 		 811 aa  292  6e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  27.75 
 
 		 784 aa  285  7.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  27.86 
 
 		 822 aa  283  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  27.68 
 
 		 831 aa  282  8e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  27.17 
 
 		 811 aa  277  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  26.1 
 
 		 811 aa  274  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  28.84 
 
 		 785 aa  272  5.9999999999999995e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  27.4 
 
 		 811 aa  270  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  27.45 
 
 		 762 aa  270  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  26.79 
 
 		 822 aa  269  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  26.74 
 
 		 802 aa  267  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  27.14 
 
 		 802 aa  266  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  27.28 
 
 		 801 aa  265  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  26.96 
 
 		 827 aa  262  7e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  27.34 
 
 		 811 aa  261  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  26.08 
 
 		 797 aa  257  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  27.42 
 
 		 797 aa  244  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  25.71 
 
 		 815 aa  237  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  25.68 
 
 		 824 aa  233  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  26.22 
 
 		 809 aa  231  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  24.62 
 
 		 797 aa  228  9e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  25.96 
 
 		 829 aa  225  8e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  25 
 
 		 796 aa  223  5e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  25.41 
 
 		 788 aa  217  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  26.38 
 
 		 802 aa  211  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  26.41 
 
 		 823 aa  203  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  25.32 
 
 		 794 aa  202  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  26.9 
 
 		 801 aa  201  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  22.8 
 
 		 900 aa  105  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  23.19 
 
 		 904 aa  101  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  21.63 
 
 		 984 aa  95.1  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1100 aa  75.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  26.44 
 
 		 754 aa  74.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  26.33 
 
 		 536 aa  73.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1136 aa  70.9  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1094 aa  70.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  26.43 
 
 		 536 aa  68.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  24.86 
 
 		 1145 aa  67.4  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  25.49 
 
 		 541 aa  65.9  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1076 aa  55.5  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4220  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1169 aa  53.9  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0587  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1117 aa  53.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720861  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1386  hypothetical protein  23.19 
 
 		 529 aa  53.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1070  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1095 aa  53.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.243584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0526  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1117 aa  50.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  24.75 
 
 		 650 aa  48.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3576  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1195 aa  47.8  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.61557  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>