87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2109 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  67.77 
 
 
813 aa  1210    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  58.13 
 
 
822 aa  1028    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  55.8 
 
 
827 aa  966    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  55.83 
 
 
815 aa  930    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  68.8 
 
 
811 aa  1200    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  41.94 
 
 
790 aa  648    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  64.07 
 
 
819 aa  1110    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  100 
 
 
811 aa  1689    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  41.03 
 
 
784 aa  638    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  65.84 
 
 
811 aa  1160    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  50.86 
 
 
815 aa  894    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  66.43 
 
 
831 aa  1179    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  67.77 
 
 
813 aa  1210    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  76.2 
 
 
811 aa  1335    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  57.76 
 
 
822 aa  1017    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  68.43 
 
 
811 aa  1201    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  38.06 
 
 
785 aa  594  1e-168  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  39.82 
 
 
784 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  34.18 
 
 
794 aa  494  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  33.53 
 
 
823 aa  479  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  34.2 
 
 
809 aa  478  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  33.53 
 
 
824 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  32.93 
 
 
797 aa  461  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  32.42 
 
 
801 aa  459  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  31.63 
 
 
797 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  33.13 
 
 
796 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  31.75 
 
 
802 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  31.75 
 
 
802 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  32.62 
 
 
797 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  30.6 
 
 
829 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  31.83 
 
 
786 aa  409  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  30.7 
 
 
762 aa  408  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  30.01 
 
 
849 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  28.3 
 
 
3021 aa  323  7e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  29.37 
 
 
2916 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  29.2 
 
 
2922 aa  321  3e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  29.59 
 
 
2887 aa  320  6e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.86 
 
 
2901 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  26.84 
 
 
2929 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  27.37 
 
 
2845 aa  300  8e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  28.18 
 
 
2932 aa  297  5e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  27.66 
 
 
2831 aa  294  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  27.36 
 
 
2905 aa  293  7e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  26.79 
 
 
2823 aa  291  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  27.54 
 
 
2868 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  25.53 
 
 
2888 aa  290  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  24.59 
 
 
1303 aa  290  8e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  26.31 
 
 
2747 aa  288  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.55 
 
 
2732 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.42 
 
 
2864 aa  282  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  25.33 
 
 
2748 aa  280  6e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.51 
 
 
2859 aa  279  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  26.41 
 
 
2748 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  27.09 
 
 
2874 aa  279  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  26.86 
 
 
2875 aa  278  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  26.17 
 
 
2758 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  26.93 
 
 
2860 aa  274  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  26.31 
 
 
2880 aa  273  8.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  26.9 
 
 
2864 aa  268  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  26.85 
 
 
2864 aa  267  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  27.44 
 
 
2842 aa  267  5.999999999999999e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.98 
 
 
2868 aa  262  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  28.88 
 
 
624 aa  260  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  25.51 
 
 
2839 aa  258  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  24.37 
 
 
2870 aa  257  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  27.34 
 
 
2833 aa  256  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  25.53 
 
 
2881 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  25.41 
 
 
2839 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  25.2 
 
 
2786 aa  255  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  27.12 
 
 
2884 aa  253  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  25.78 
 
 
2716 aa  246  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  25.97 
 
 
2793 aa  237  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  26.31 
 
 
2761 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  25.37 
 
 
2769 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  25 
 
 
2730 aa  216  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  24.09 
 
 
2731 aa  213  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  24.61 
 
 
2779 aa  205  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  23.05 
 
 
801 aa  165  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  21.37 
 
 
788 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  22.68 
 
 
802 aa  137  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  21.51 
 
 
984 aa  120  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  30 
 
 
2453 aa  84  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  21.34 
 
 
900 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  22.06 
 
 
904 aa  68.2  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  24.88 
 
 
1100 aa  48.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  26.95 
 
 
1094 aa  45.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  28.93 
 
 
1145 aa  44.3  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>