58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06430 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  100 
 
 		 1145 aa  2280    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  36.88 
 
 		 1136 aa  621  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  36.4 
 
 		 1100 aa  588  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1094 aa  582  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  35.73 
 
 		 1076 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4220  hypothetical protein  36.06 
 
 		 1169 aa  573  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  32.6 
 
 		 1113 aa  567  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0587  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1117 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1070  hypothetical protein  32.78 
 
 		 1095 aa  551  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.243584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0526  hypothetical protein  32.78 
 
 		 1117 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3576  hypothetical protein  35.6 
 
 		 1195 aa  477  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.61557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  25.6 
 
 		 2901 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  24.27 
 
 		 2845 aa  64.7  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  25 
 
 		 849 aa  63.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  25.1 
 
 		 2732 aa  62.4  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  24.68 
 
 		 2833 aa  60.1  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  23.97 
 
 		 2716 aa  60.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  24.66 
 
 		 2859 aa  58.5  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  25.17 
 
 		 2875 aa  58.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  24.71 
 
 		 2864 aa  58.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  24.54 
 
 		 2881 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  23.37 
 
 		 624 aa  57.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  24.52 
 
 		 2831 aa  57  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  24.72 
 
 		 2874 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  30.14 
 
 		 815 aa  56.2  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  24.89 
 
 		 2905 aa  55.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  23.37 
 
 		 2868 aa  55.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  25.32 
 
 		 784 aa  55.5  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  24.65 
 
 		 2888 aa  55.1  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  22.36 
 
 		 2860 aa  55.5  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  26.92 
 
 		 784 aa  54.7  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  23.51 
 
 		 2839 aa  54.3  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  25.17 
 
 		 785 aa  53.5  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  24.31 
 
 		 2868 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  31.4 
 
 		 822 aa  52.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  22.79 
 
 		 2786 aa  52.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  23.78 
 
 		 3021 aa  52  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  23.27 
 
 		 2747 aa  52  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  22.45 
 
 		 2870 aa  51.6  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  22.89 
 
 		 788 aa  51.6  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  23.19 
 
 		 2864 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  27.72 
 
 		 2748 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  27.45 
 
 		 2922 aa  50.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  23.56 
 
 		 801 aa  50.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  23.04 
 
 		 1303 aa  49.3  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  30.58 
 
 		 827 aa  48.9  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  22.22 
 
 		 2761 aa  48.5  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  27.68 
 
 		 790 aa  47.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  23.37 
 
 		 2769 aa  48.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  22.3 
 
 		 2929 aa  47  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  27.27 
 
 		 813 aa  47.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  27.27 
 
 		 813 aa  47.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  28.48 
 
 		 2758 aa  46.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  28.48 
 
 		 2748 aa  46.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  20.32 
 
 		 2887 aa  45.8  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  24.77 
 
 		 2916 aa  45.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  22.94 
 
 		 802 aa  45.4  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  24.09 
 
 		 2880 aa  44.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>