47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3576 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  41.38 
 
 		 1136 aa  741    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3576  hypothetical protein  100 
 
 		 1195 aa  2324    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.61557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  37.69 
 
 		 1100 aa  555  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  37.84 
 
 		 1094 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4220  hypothetical protein  36.07 
 
 		 1169 aa  522  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  35.92 
 
 		 1145 aa  498  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  29.15 
 
 		 1113 aa  452  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  47.98 
 
 		 1076 aa  369  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1070  hypothetical protein  34.79 
 
 		 1095 aa  335  4e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.243584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0587  hypothetical protein  34.79 
 
 		 1117 aa  333  9e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720861  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0526  hypothetical protein  34.79 
 
 		 1117 aa  333  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  25.83 
 
 		 2732 aa  71.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  25.38 
 
 		 2881 aa  68.6  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  25.83 
 
 		 2864 aa  68.2  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  28.45 
 
 		 2747 aa  64.3  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  23.95 
 
 		 2880 aa  63.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  24.71 
 
 		 2888 aa  62.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  26.11 
 
 		 2932 aa  62.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  27.16 
 
 		 2748 aa  62.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  24.52 
 
 		 2905 aa  57  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  31.46 
 
 		 2793 aa  57  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  26.73 
 
 		 2761 aa  56.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  23.11 
 
 		 2860 aa  55.8  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  25.3 
 
 		 2833 aa  55.5  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  25.1 
 
 		 785 aa  55.1  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  25 
 
 		 788 aa  55.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  27.95 
 
 		 801 aa  55.1  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  31.98 
 
 		 2748 aa  54.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  31.98 
 
 		 2758 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  27.59 
 
 		 784 aa  54.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  28.93 
 
 		 2916 aa  53.5  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  24.9 
 
 		 2845 aa  53.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  24.26 
 
 		 1303 aa  52  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  21.87 
 
 		 786 aa  51.2  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  24.19 
 
 		 2731 aa  50.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  32.57 
 
 		 2716 aa  51.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  26.96 
 
 		 790 aa  51.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  26.32 
 
 		 2779 aa  50.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  29.84 
 
 		 2786 aa  48.9  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  25.9 
 
 		 2769 aa  48.5  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  28.81 
 
 		 2730 aa  48.5  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  31.11 
 
 		 2870 aa  47.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  30.81 
 
 		 2859 aa  47.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  28.73 
 
 		 2864 aa  47.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  28.32 
 
 		 2868 aa  47  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  25.12 
 
 		 809 aa  45.8  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  26.25 
 
 		 822 aa  45.1  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>