97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2531 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  44.37 
 
 
2864 aa  2171    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  59.87 
 
 
2761 aa  3064    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  45.85 
 
 
2929 aa  1437    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  69.78 
 
 
2842 aa  3887    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  45.66 
 
 
3021 aa  1330    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  44.83 
 
 
2864 aa  2367    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  44.9 
 
 
2864 aa  2189    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  44.44 
 
 
1303 aa  1045    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  44.44 
 
 
2870 aa  2294    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  44.75 
 
 
2888 aa  2359    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  49.78 
 
 
2748 aa  1439    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  48.68 
 
 
2747 aa  1451    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  44.28 
 
 
2839 aa  2255    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  50.44 
 
 
2758 aa  1412    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  42.61 
 
 
2880 aa  2118    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  37.82 
 
 
2823 aa  1966    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  38.94 
 
 
2453 aa  1337    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  44.55 
 
 
2839 aa  2274    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  42.88 
 
 
2730 aa  1127    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  39.92 
 
 
2887 aa  2192    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  44.31 
 
 
2833 aa  2287    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  43.9 
 
 
2881 aa  2073    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  57.05 
 
 
2874 aa  2988    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  56.33 
 
 
2875 aa  3026    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  43.42 
 
 
2916 aa  2142    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  45.53 
 
 
2732 aa  2318    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  43.57 
 
 
2932 aa  2115    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  43.88 
 
 
2859 aa  2122    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  59.92 
 
 
2769 aa  3130    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  43.63 
 
 
2905 aa  2133    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  50.19 
 
 
2748 aa  1394    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  42.18 
 
 
2786 aa  1327    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  39.53 
 
 
2793 aa  1723    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  58.64 
 
 
2901 aa  3159    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  72.1 
 
 
2868 aa  4041    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  100 
 
 
2845 aa  5704    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  56.82 
 
 
2868 aa  3007    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  41.8 
 
 
2716 aa  1129    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  56.95 
 
 
2831 aa  2972    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  42.07 
 
 
2779 aa  1928    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  42.86 
 
 
2731 aa  1127    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  41.08 
 
 
2860 aa  2046    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  41.08 
 
 
2884 aa  2184    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  38.87 
 
 
2922 aa  2101    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  48.55 
 
 
624 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  38.18 
 
 
849 aa  506  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  36.45 
 
 
786 aa  494  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  30.33 
 
 
822 aa  359  3.9999999999999996e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  30.57 
 
 
813 aa  351  1e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  30.57 
 
 
813 aa  351  1e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  29.27 
 
 
790 aa  330  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  28 
 
 
811 aa  330  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  29.32 
 
 
811 aa  329  4.0000000000000003e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  30.11 
 
 
815 aa  325  9.999999999999999e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  28.57 
 
 
801 aa  320  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  29.4 
 
 
784 aa  318  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  28.62 
 
 
811 aa  318  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  28.33 
 
 
819 aa  317  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  28.5 
 
 
811 aa  315  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  28.21 
 
 
802 aa  314  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  30.24 
 
 
785 aa  309  6e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  28.21 
 
 
802 aa  308  8.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  29.26 
 
 
822 aa  299  5e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  28.16 
 
 
784 aa  298  9e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  28.24 
 
 
762 aa  291  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  27.09 
 
 
831 aa  291  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  28.13 
 
 
815 aa  290  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  27.52 
 
 
811 aa  288  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  29 
 
 
829 aa  286  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  28.75 
 
 
797 aa  281  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  29.38 
 
 
827 aa  275  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  28.99 
 
 
823 aa  271  8.999999999999999e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  29.28 
 
 
794 aa  271  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  27.13 
 
 
809 aa  270  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  25.89 
 
 
797 aa  263  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  25.06 
 
 
797 aa  252  7e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  26.41 
 
 
796 aa  239  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  25.74 
 
 
824 aa  239  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  25.68 
 
 
788 aa  218  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  27.29 
 
 
801 aa  191  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  22.49 
 
 
802 aa  169  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  21.74 
 
 
984 aa  106  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  24.81 
 
 
1136 aa  82.4  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  28.04 
 
 
536 aa  74.3  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  23.31 
 
 
1100 aa  67.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  24.27 
 
 
1145 aa  64.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  36.6 
 
 
754 aa  61.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  22.89 
 
 
1094 aa  58.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  24.83 
 
 
536 aa  57.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0524  hypothetical protein  27.27 
 
 
459 aa  56.6  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00628478  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  24.31 
 
 
541 aa  56.6  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0585  hypothetical protein  27.27 
 
 
459 aa  56.6  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0392402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1072  hypothetical protein  27.27 
 
 
459 aa  55.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  24.84 
 
 
904 aa  55.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  26.89 
 
 
1076 aa  53.1  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  22.33 
 
 
900 aa  49.7  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4220  hypothetical protein  21.87 
 
 
1169 aa  48.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.559819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>