86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3412 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  100 
 
 
824 aa  1719    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  44.12 
 
 
794 aa  730    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  43.39 
 
 
797 aa  711    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  56.85 
 
 
809 aa  970    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  42.39 
 
 
823 aa  709    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  52.48 
 
 
796 aa  910    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  55.35 
 
 
797 aa  951    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  39.54 
 
 
790 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  36.89 
 
 
801 aa  534  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  36.48 
 
 
802 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  36.24 
 
 
802 aa  528  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  36.44 
 
 
784 aa  508  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  34.57 
 
 
797 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  35.51 
 
 
784 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  34.11 
 
 
813 aa  504  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  34.11 
 
 
813 aa  504  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  34.84 
 
 
811 aa  501  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  33.41 
 
 
785 aa  500  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  36.87 
 
 
762 aa  498  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  34.18 
 
 
829 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  34.58 
 
 
811 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  34.39 
 
 
811 aa  490  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  34.06 
 
 
819 aa  478  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  32.24 
 
 
815 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  32.71 
 
 
811 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  33.14 
 
 
831 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  33.53 
 
 
811 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  31.07 
 
 
822 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  30.12 
 
 
822 aa  438  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  32.29 
 
 
815 aa  428  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  32.16 
 
 
786 aa  421  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  30.44 
 
 
827 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  29.05 
 
 
849 aa  360  6e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  25.87 
 
 
1303 aa  292  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  27.54 
 
 
2922 aa  289  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  26.14 
 
 
2929 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  26.27 
 
 
3021 aa  282  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  27.37 
 
 
2887 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.42 
 
 
2859 aa  279  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  27.57 
 
 
2916 aa  277  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  26.3 
 
 
2932 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  26.72 
 
 
2905 aa  258  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  26.34 
 
 
2864 aa  255  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  25.86 
 
 
2864 aa  254  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  25.86 
 
 
2732 aa  255  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  27.1 
 
 
2901 aa  253  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  25.61 
 
 
2823 aa  252  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  25.63 
 
 
2786 aa  251  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  25.21 
 
 
2888 aa  250  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  26.04 
 
 
2864 aa  250  9e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  24.65 
 
 
2880 aa  244  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  27.09 
 
 
2839 aa  243  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  26 
 
 
2839 aa  241  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  25.74 
 
 
2845 aa  239  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  26.64 
 
 
2875 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26 
 
 
2868 aa  239  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  26.22 
 
 
2831 aa  237  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  26.74 
 
 
2842 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  26.13 
 
 
2860 aa  236  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  23.54 
 
 
2748 aa  235  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  26.22 
 
 
2868 aa  235  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  24.35 
 
 
2748 aa  232  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  25.06 
 
 
2881 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  24.26 
 
 
2758 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  25.68 
 
 
2833 aa  228  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  26.89 
 
 
2874 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  26.07 
 
 
2870 aa  227  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  26.55 
 
 
624 aa  224  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  24.88 
 
 
2747 aa  220  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  25.15 
 
 
2761 aa  218  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  24.82 
 
 
2884 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  24.6 
 
 
2716 aa  213  9e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  25.53 
 
 
2769 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  23.97 
 
 
2779 aa  195  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  24 
 
 
788 aa  191  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  23.38 
 
 
801 aa  180  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  22.56 
 
 
2793 aa  178  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  27.52 
 
 
2731 aa  167  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  26.36 
 
 
2730 aa  160  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  21.2 
 
 
802 aa  151  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  22.26 
 
 
984 aa  102  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  28.49 
 
 
2453 aa  78.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  20.15 
 
 
900 aa  60.1  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  21.2 
 
 
904 aa  59.3  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.42 
 
 
816 aa  47.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1826  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.91 
 
 
835 aa  45.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>