87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2312 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  42.26 
 
 
797 aa  661    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  55.68 
 
 
823 aa  954    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  61.83 
 
 
794 aa  1030    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  100 
 
 
797 aa  1662    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  43.4 
 
 
809 aa  714    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  41.05 
 
 
790 aa  640    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  42.33 
 
 
796 aa  677    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  43.39 
 
 
824 aa  711    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  38.22 
 
 
802 aa  553  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  37.98 
 
 
784 aa  550  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  37.73 
 
 
802 aa  546  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  38.13 
 
 
797 aa  548  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  38.07 
 
 
785 aa  528  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  37.18 
 
 
801 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  37.94 
 
 
784 aa  520  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  36.08 
 
 
829 aa  515  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  35.09 
 
 
811 aa  501  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  37.03 
 
 
762 aa  501  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  34.35 
 
 
811 aa  501  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  35.31 
 
 
813 aa  484  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  35.31 
 
 
813 aa  484  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  34.29 
 
 
811 aa  478  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  34.31 
 
 
815 aa  476  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  36.17 
 
 
815 aa  475  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  33.5 
 
 
819 aa  475  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  33.98 
 
 
822 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  32.98 
 
 
831 aa  469  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  33.77 
 
 
811 aa  463  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  32.93 
 
 
811 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  33.25 
 
 
822 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  33.76 
 
 
827 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  30.36 
 
 
786 aa  395  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  31.56 
 
 
849 aa  385  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  29.75 
 
 
1303 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  29.5 
 
 
3021 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  27.78 
 
 
2887 aa  297  5e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  29.63 
 
 
2916 aa  291  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  29.6 
 
 
2761 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  29.84 
 
 
2748 aa  290  8e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  28.47 
 
 
2901 aa  289  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  27.84 
 
 
2922 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  28.81 
 
 
2932 aa  283  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  28.75 
 
 
2845 aa  281  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  28.02 
 
 
2929 aa  280  9e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  28.87 
 
 
2864 aa  277  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  29.3 
 
 
2769 aa  273  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  28.28 
 
 
2786 aa  272  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  28.36 
 
 
2842 aa  269  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  28.98 
 
 
2716 aa  268  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  28.96 
 
 
2864 aa  268  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  28.06 
 
 
2732 aa  268  4e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  27.91 
 
 
2860 aa  266  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  27.67 
 
 
2864 aa  266  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  29.09 
 
 
2881 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  27.33 
 
 
2888 aa  264  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  26.46 
 
 
2823 aa  259  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.3 
 
 
2859 aa  258  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  27.87 
 
 
2747 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  27.71 
 
 
2905 aa  251  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  26.68 
 
 
2880 aa  251  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  29.95 
 
 
624 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  27.5 
 
 
2875 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  28.04 
 
 
2748 aa  248  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  28.16 
 
 
2758 aa  247  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  28.1 
 
 
2874 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  28.41 
 
 
2868 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  27.98 
 
 
2831 aa  245  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  25.65 
 
 
788 aa  242  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  27.62 
 
 
2868 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  27.17 
 
 
2833 aa  240  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  25.62 
 
 
2839 aa  239  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  27.8 
 
 
2870 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  25.9 
 
 
2839 aa  234  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  25.96 
 
 
2793 aa  231  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  27.11 
 
 
2730 aa  230  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  26.66 
 
 
2779 aa  223  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  26.03 
 
 
2884 aa  223  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  24.83 
 
 
802 aa  204  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  25.24 
 
 
801 aa  204  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  25.19 
 
 
2731 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  21.86 
 
 
984 aa  104  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  22.09 
 
 
904 aa  82.4  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  32.32 
 
 
2453 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  24.33 
 
 
1136 aa  61.6  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  26.59 
 
 
900 aa  56.6  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  22.32 
 
 
1076 aa  46.6  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  23.69 
 
 
728 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>