96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2577 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  42.52 
 
 
2929 aa  1388    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  36.32 
 
 
2761 aa  1800    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  39.38 
 
 
2758 aa  1194    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  40.83 
 
 
3021 aa  1246    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  37.06 
 
 
2864 aa  1797    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  39.33 
 
 
2864 aa  2032    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  41.68 
 
 
1303 aa  1044    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  35.73 
 
 
2870 aa  1745    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  36.98 
 
 
2888 aa  1800    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  40.22 
 
 
2748 aa  1260    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  36.64 
 
 
2786 aa  1831    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  39.25 
 
 
2864 aa  2009    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  37.55 
 
 
2842 aa  1920    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  37.6 
 
 
2880 aa  1975    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  37.35 
 
 
2716 aa  1082    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  41.74 
 
 
2916 aa  1322    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  36.18 
 
 
2839 aa  1734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  35.72 
 
 
2839 aa  1722    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  45.19 
 
 
2887 aa  2616    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  39.12 
 
 
2747 aa  1218    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  37.44 
 
 
2881 aa  1956    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  36.75 
 
 
2874 aa  1851    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  36.62 
 
 
2875 aa  1892    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  37.89 
 
 
2453 aa  687    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  36.6 
 
 
2868 aa  1873    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  38.37 
 
 
2905 aa  2031    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  36.89 
 
 
2769 aa  1879    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  39.45 
 
 
2748 aa  1178    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  36.64 
 
 
2833 aa  1775    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  38.59 
 
 
2859 aa  2027    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  32.29 
 
 
2793 aa  1476    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  37.61 
 
 
2901 aa  1935    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  36.61 
 
 
2868 aa  1902    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  37.82 
 
 
2845 aa  1967    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  34.21 
 
 
2730 aa  959    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  100 
 
 
2823 aa  5868    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  36.78 
 
 
2831 aa  1867    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  33.32 
 
 
2779 aa  1548    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  34.27 
 
 
2731 aa  980    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  36.06 
 
 
2884 aa  1738    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  37.85 
 
 
2932 aa  1993    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  37.46 
 
 
2732 aa  1784    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  45.03 
 
 
2922 aa  2611    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  36.73 
 
 
2860 aa  1924    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  46.72 
 
 
624 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  37.45 
 
 
849 aa  535  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  37.56 
 
 
786 aa  527  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  29.87 
 
 
784 aa  346  4e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  30.21 
 
 
785 aa  343  2e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  29.83 
 
 
790 aa  334  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  29.34 
 
 
813 aa  331  1.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  29.34 
 
 
813 aa  331  1.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  29 
 
 
784 aa  327  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  29.14 
 
 
811 aa  321  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  28.91 
 
 
811 aa  315  7.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  27.92 
 
 
815 aa  312  5e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  27.42 
 
 
801 aa  307  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  30 
 
 
811 aa  303  4e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  26.89 
 
 
802 aa  300  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  27.5 
 
 
822 aa  300  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  26.74 
 
 
802 aa  300  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  27.51 
 
 
811 aa  293  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  27.68 
 
 
815 aa  281  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  27.07 
 
 
831 aa  281  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  26.51 
 
 
797 aa  276  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  26.79 
 
 
811 aa  276  5.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  25.73 
 
 
829 aa  274  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  26.66 
 
 
762 aa  273  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  26.53 
 
 
819 aa  272  7e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  26.74 
 
 
794 aa  262  7e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  26.1 
 
 
796 aa  261  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  26.46 
 
 
797 aa  258  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  26.12 
 
 
797 aa  258  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  25.35 
 
 
822 aa  255  7e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  25.61 
 
 
824 aa  252  8e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  25.48 
 
 
809 aa  244  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  25.68 
 
 
823 aa  233  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  25.18 
 
 
827 aa  230  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  22.43 
 
 
802 aa  163  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  23.58 
 
 
801 aa  160  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  23.8 
 
 
788 aa  159  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  21.24 
 
 
984 aa  80.5  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  20.16 
 
 
900 aa  76.6  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  24.4 
 
 
536 aa  73.2  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  20 
 
 
904 aa  72.8  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  25.43 
 
 
536 aa  70.1  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4220  hypothetical protein  22.56 
 
 
1169 aa  67.4  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  22.4 
 
 
541 aa  63.2  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  22.13 
 
 
1100 aa  62  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  34.92 
 
 
754 aa  62.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1070  hypothetical protein  21.49 
 
 
1095 aa  61.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.243584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0587  hypothetical protein  21.53 
 
 
1117 aa  60.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720861  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0526  hypothetical protein  21.53 
 
 
1117 aa  59.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  21.89 
 
 
1094 aa  57  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  19.69 
 
 
1113 aa  56.2  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  21.79 
 
 
1136 aa  49.7  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>