More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0888 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  100 
 
 		 603 aa  1221    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  71.83 
 
 		 520 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  71.1 
 
 		 433 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  69.25 
 
 		 509 aa  545  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  65.73 
 
 		 504 aa  481  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  67.88 
 
 		 498 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  68.18 
 
 		 498 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  67.34 
 
 		 413 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  60.73 
 
 		 376 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  59.34 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  59.04 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  59.04 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  60.24 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  57.68 
 
 		 357 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  56.3 
 
 		 441 aa  363  4e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  57.8 
 
 		 360 aa  357  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  56.02 
 
 		 355 aa  352  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  58.39 
 
 		 366 aa  349  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  57.7 
 
 		 331 aa  347  4e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  56.75 
 
 		 355 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  54.71 
 
 		 446 aa  337  3.9999999999999995e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  56.72 
 
 		 378 aa  335  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  52.41 
 
 		 358 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  56.97 
 
 		 325 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  56.76 
 
 		 389 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  51.07 
 
 		 375 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  50.15 
 
 		 399 aa  298  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  50.61 
 
 		 373 aa  298  3e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  49.23 
 
 		 435 aa  285  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  49.18 
 
 		 355 aa  283  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  47.02 
 
 		 364 aa  267  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  49.52 
 
 		 363 aa  266  8.999999999999999e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  43.75 
 
 		 378 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  43.75 
 
 		 378 aa  263  8e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  44.06 
 
 		 393 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  44.54 
 
 		 374 aa  260  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  42.9 
 
 		 378 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  42.86 
 
 		 370 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  43.1 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0093  Ppx/GppA phosphatase  45.53 
 
 		 377 aa  253  7e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  31.31 
 
 		 513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  31.66 
 
 		 513 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  31.07 
 
 		 549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  29.81 
 
 		 513 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  30.68 
 
 		 545 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  30.68 
 
 		 545 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  31.31 
 
 		 319 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  30.03 
 
 		 500 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  30.35 
 
 		 500 aa  125  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  35.23 
 
 		 318 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  32.43 
 
 		 311 aa  124  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  29.33 
 
 		 550 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  35.74 
 
 		 307 aa  124  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  35.33 
 
 		 311 aa  123  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  31.31 
 
 		 510 aa  123  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  29.43 
 
 		 305 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  31.63 
 
 		 511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  33.74 
 
 		 311 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 		 310 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  32.08 
 
 		 318 aa  121  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  34.45 
 
 		 353 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 		 311 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  29.82 
 
 		 570 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  30.7 
 
 		 568 aa  120  9e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  36.08 
 
 		 303 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  34.58 
 
 		 300 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2679  Ppx/GppA phosphatase  32.67 
 
 		 327 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  35.11 
 
 		 300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 		 318 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3920  Ppx/GppA phosphatase  30.41 
 
 		 353 aa  114  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  31.76 
 
 		 505 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  34.77 
 
 		 330 aa  113  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  30.25 
 
 		 301 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0772  exopolyphosphatase  32.18 
 
 		 333 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  29.38 
 
 		 502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  26.88 
 
 		 507 aa  112  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  30.28 
 
 		 308 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  30.28 
 
 		 331 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  29.28 
 
 		 557 aa  110  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0074  Ppx/GppA phosphatase  30.06 
 
 		 326 aa  109  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10959  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  33.55 
 
 		 304 aa  109  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  33.96 
 
 		 312 aa  109  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0931  Ppx/GppA phosphatase  30.79 
 
 		 308 aa  109  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  27.47 
 
 		 519 aa  108  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  28.09 
 
 		 521 aa  107  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  30.82 
 
 		 321 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  27.02 
 
 		 305 aa  107  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0923  Ppx/GppA phosphatase  30.53 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  29.86 
 
 		 550 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  29.43 
 
 		 502 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  31.11 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.25 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0329  Ppx/GppA phosphatase  31.71 
 
 		 303 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  27.13 
 
 		 506 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  29.17 
 
 		 326 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1628  exopolyphosphatase  26.93 
 
 		 326 aa  105  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  34.29 
 
 		 307 aa  104  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  27.93 
 
 		 519 aa  104  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0692  Ppx/GppA phosphatase  34.49 
 
 		 305 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.224479  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  28.16 
 
 		 296 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>