More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0031 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0656  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  75.06 
 
 
437 aa  634    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1260  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  75.92 
 
 
436 aa  666    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2079  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.85 
 
 
434 aa  698    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4311  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  88.28 
 
 
435 aa  777    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0129  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  72.41 
 
 
433 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.768224  normal  0.321326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0152  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  72.41 
 
 
434 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0031  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  100 
 
 
435 aa  870    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0841  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  79.31 
 
 
434 aa  707    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1240  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.95 
 
 
435 aa  650    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.543485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2296  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  73.56 
 
 
435 aa  658    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.238027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0302  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  73.33 
 
 
434 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0418  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  72.64 
 
 
433 aa  634    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0120  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  73.33 
 
 
433 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.417089  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3983  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  88.74 
 
 
435 aa  781    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3490  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  79.36 
 
 
436 aa  702    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3266  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  83.68 
 
 
435 aa  742    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5465  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  74.14 
 
 
437 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1999  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.39 
 
 
434 aa  692    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0645  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  74.83 
 
 
437 aa  633  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal  0.159408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0403  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  72.18 
 
 
433 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.236378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0257  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  74.14 
 
 
437 aa  633  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0308  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  72.41 
 
 
433 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0624  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  74.6 
 
 
437 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.770577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0251  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.43 
 
 
435 aa  620  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.600656  normal  0.544782 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2983  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.97 
 
 
435 aa  619  1e-176  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3084  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.4 
 
 
437 aa  617  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0435809  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2559  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.85 
 
 
437 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.358535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3600  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.13 
 
 
435 aa  597  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00234742  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2851  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.28 
 
 
436 aa  591  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192992  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3441  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.82 
 
 
437 aa  588  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.37686  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0187  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.43 
 
 
438 aa  578  1e-164  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0444321  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2790  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.76 
 
 
435 aa  555  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1532  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.22 
 
 
433 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2948  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  62.99 
 
 
433 aa  554  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.474337  normal  0.124858 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0182  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.22 
 
 
433 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5052  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.05 
 
 
431 aa  526  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42386  normal  0.164562 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3083  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.73 
 
 
438 aa  524  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0175697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1409  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.76 
 
 
439 aa  520  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1190  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.6 
 
 
437 aa  515  1.0000000000000001e-145  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.298692  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0204  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.47 
 
 
446 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337304  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0805  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.06 
 
 
492 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.332648  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0015  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.46 
 
 
461 aa  515  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1595  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.74 
 
 
433 aa  512  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.472132  normal  0.884744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4377  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.06 
 
 
433 aa  511  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0168  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.24 
 
 
443 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0997  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.06 
 
 
487 aa  509  1e-143  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0599  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.45 
 
 
441 aa  510  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0072  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.44 
 
 
447 aa  510  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0179  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.74 
 
 
443 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0067  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.27 
 
 
440 aa  505  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2114  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60 
 
 
465 aa  506  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3782  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.23 
 
 
441 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.268349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0057  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  59.6 
 
 
444 aa  502  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408482  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2015  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.01 
 
 
440 aa  503  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.788051  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3708  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.47 
 
 
443 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0165  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.67 
 
 
443 aa  501  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0446  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.98 
 
 
442 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2247  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.3 
 
 
443 aa  499  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4163  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.47 
 
 
440 aa  500  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3798  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  58.84 
 
 
443 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001749  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  58.52 
 
 
443 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28369  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3385  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.24 
 
 
443 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0433  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.98 
 
 
442 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0530  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.11 
 
 
441 aa  501  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.10008  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0374  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.11 
 
 
441 aa  500  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.191094  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0042  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.56 
 
 
443 aa  497  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0472  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.53 
 
 
442 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04279  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.4 
 
 
485 aa  498  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00723  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.07 
 
 
443 aa  495  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45390  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.8 
 
 
446 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1585  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.52 
 
 
448 aa  497  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.157035  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3362  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.33 
 
 
441 aa  497  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0132  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.24 
 
 
439 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0500755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3522  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.98 
 
 
442 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0462  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.53 
 
 
442 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4430  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.66 
 
 
441 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193952  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3700  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.98 
 
 
442 aa  498  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62855  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3868  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.53 
 
 
442 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.17 
 
 
443 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4370  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.62 
 
 
443 aa  493  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.17 
 
 
443 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2412  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.82 
 
 
445 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.874746  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0404  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.69 
 
 
440 aa  491  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0953822  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2546  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.49 
 
 
443 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4104  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.17 
 
 
443 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0113  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  56.73 
 
 
443 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2698  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.28 
 
 
438 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.408772  decreased coverage  0.000313907 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3471  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.74 
 
 
457 aa  492  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0817  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.17 
 
 
443 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.544231  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0440  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.33 
 
 
441 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3765  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.76 
 
 
441 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000246667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0528  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.53 
 
 
442 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5001  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.78 
 
 
447 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4793  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.49 
 
 
444 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000260414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0342  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.54 
 
 
448 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0396  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.57 
 
 
445 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4875  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.78 
 
 
447 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129232  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5051  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.56 
 
 
447 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4381  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.1 
 
 
448 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66790  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.51 
 
 
447 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>