172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1755 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  100 
 
 
306 aa  583  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  78.76 
 
 
307 aa  439  1e-122  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  44.73 
 
 
328 aa  225  8e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  46.4 
 
 
326 aa  205  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  48.39 
 
 
246 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  43.99 
 
 
343 aa  183  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  47.49 
 
 
241 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  47.49 
 
 
241 aa  179  5e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  46.58 
 
 
241 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0993  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  41.42 
 
 
344 aa  165  7e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  50.26 
 
 
216 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  50.78 
 
 
218 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  45.58 
 
 
235 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1351  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  47.22 
 
 
233 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  47 
 
 
242 aa  159  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4293  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  50.72 
 
 
230 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1327  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  48.6 
 
 
229 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.871033  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  45.41 
 
 
229 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2134  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  45.66 
 
 
261 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  46.51 
 
 
232 aa  156  5e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  46.51 
 
 
232 aa  156  5e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  46.51 
 
 
232 aa  156  5e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0061  ABC-type transport system, permease component  40.19 
 
 
301 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.43136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  43.72 
 
 
235 aa  147  1e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  42.38 
 
 
213 aa  146  4e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0681  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.33 
 
 
333 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  42.18 
 
 
213 aa  140  2e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  38.03 
 
 
212 aa  140  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  39.91 
 
 
212 aa  139  8e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1292  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36 
 
 
299 aa  138  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46518  normal  0.800906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2752  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.96 
 
 
354 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  40 
 
 
210 aa  136  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1803  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.48 
 
 
352 aa  136  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  38.97 
 
 
212 aa  136  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  40.57 
 
 
204 aa  135  7e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1006  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  46.95 
 
 
238 aa  135  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1402  cobalt transport protein CbiM  43.81 
 
 
212 aa  132  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  40.19 
 
 
214 aa  132  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0712  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.8 
 
 
332 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.218257  hitchhiker  3.57899e-06 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1182  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.33 
 
 
331 aa  128  9e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00505251  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  40.69 
 
 
202 aa  127  2e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1200  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.37 
 
 
347 aa  126  4e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.028093  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2762  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.03 
 
 
348 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1279  cobalamin biosynthesis protein CbiM, putative  32.75 
 
 
343 aa  121  1e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0499926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  36.64 
 
 
230 aa  120  2e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0486  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.93 
 
 
337 aa  120  2e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.16 
 
 
348 aa  119  4e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.7293e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0391  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  41.43 
 
 
202 aa  119  5e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.026574  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1116  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  44.6 
 
 
238 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1569  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  45.02 
 
 
233 aa  117  2e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.33 
 
 
355 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38373e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2769  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.94 
 
 
342 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34 
 
 
310 aa  116  4e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118647  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.87 
 
 
219 aa  115  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  32.17 
 
 
239 aa  115  7e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  37.17 
 
 
226 aa  115  8e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0213  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  41.9 
 
 
202 aa  114  1e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.655003  normal  0.171707 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1793  cobalt transport protein CbiM  39.17 
 
 
218 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  1.28429e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1805  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.84 
 
 
341 aa  112  1e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.23856e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1243  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.97 
 
 
233 aa  109  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  3.23865e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2225  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.7 
 
 
359 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000325574  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2441  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.61 
 
 
346 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2352  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.51 
 
 
310 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  33.04 
 
 
330 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  32.6 
 
 
226 aa  103  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.12 
 
 
421 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  38.22 
 
 
352 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2005  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.08 
 
 
343 aa  102  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0387041  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  33.92 
 
 
242 aa  102  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0492  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.99 
 
 
337 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.267913  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.31 
 
 
232 aa  99.4  7e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0330  cobalt transport protein CbiM  33.48 
 
 
325 aa  96.3  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11090  cobalt transport protein CbiM  30.16 
 
 
339 aa  92.4  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  3.40042e-06  normal  0.0123253 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0557  cobalamin biosynthesis protein CbiM, putative  33.86 
 
 
326 aa  87  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2022  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.74 
 
 
197 aa  85.9  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  9.20884e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  35.27 
 
 
256 aa  80.5  3e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  35.71 
 
 
245 aa  80.5  3e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1321  cobalt transport protein CbiM  33.33 
 
 
211 aa  79.3  8e-14  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1365  cobalt transport protein CbiM  33.33 
 
 
211 aa  79.3  8e-14  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3500  cobalt transport protein CbiM  35.75 
 
 
211 aa  78.6  1e-13  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0062  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.07 
 
 
213 aa  75.1  1e-12  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000311798  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1951  cobalt transport protein CbiM  32.04 
 
 
211 aa  73.6  4e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  29.65 
 
 
321 aa  72.8  7e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  33.02 
 
 
225 aa  72.8  7e-12  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  33.8 
 
 
225 aa  72.8  7e-12  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3139  cobalt transport protein CbiM  36.75 
 
 
204 aa  72.4  8e-12  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  34.88 
 
 
225 aa  72.4  9e-12  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2305  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.23 
 
 
210 aa  71.2  2e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0543  cobalamin biosynthesis protein CbiM  32.6 
 
 
226 aa  70.9  2e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  30.97 
 
 
251 aa  70.5  3e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  32.42 
 
 
225 aa  70.5  3e-11  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  30.04 
 
 
250 aa  70.1  4e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2033  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.33 
 
 
217 aa  68.6  1e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1276  cobalamin biosynthesis protein CbiM  30.7 
 
 
246 aa  67.4  3e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  31.05 
 
 
229 aa  67.4  3e-10  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0495  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM  38.21 
 
 
210 aa  65.1  1e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.17 
 
 
430 aa  65.5  1e-09  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  29.61 
 
 
231 aa  65.5  1e-09  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0146  cobalt transport protein CbiM  29.31 
 
 
221 aa  65.1  1e-09  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0185688  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1190  cobalt transport protein CbiM  31.02 
 
 
204 aa  65.5  1e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  4.65772e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>