129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1276 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1276  cobalamin biosynthesis protein CbiM  100 
 
 
246 aa  473  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0560  cobalamin biosynthesis protein CbiM  77.96 
 
 
249 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1545  cobalt transport protein CbiM  64.6 
 
 
246 aa  278  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3736  cobalamin biosynthesis protein CbiM  63.47 
 
 
251 aa  278  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  60.58 
 
 
249 aa  277  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1060  cobalt transport protein CbiM  64.6 
 
 
254 aa  274  9e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2620  cobalt transport protein CbiM  63.93 
 
 
247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3660  cobalt transport protein CbiM  65.12 
 
 
225 aa  265  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1222  cobalt transport protein CbiM  64.38 
 
 
234 aa  265  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.955789  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2601  cobalt transport protein CbiM  63.64 
 
 
246 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184682  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0182  cobalt transport protein CbiM  59.11 
 
 
247 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0185  cobalt transport protein CbiM  58.3 
 
 
247 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.878644  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1697  cobalt transport protein CbiM  66.67 
 
 
225 aa  262  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.30926 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0927  cobalamin biosynthesis protein CbiM  62.78 
 
 
250 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326506  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  58.52 
 
 
236 aa  259  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  57.75 
 
 
235 aa  258  9e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1241  cobalt transport protein CbiM  61.64 
 
 
226 aa  257  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.335474  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3820  cobalt transport protein CbiM  63.8 
 
 
249 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1226  cobalt transport protein CbiM  61.64 
 
 
226 aa  256  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00004415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  58.47 
 
 
250 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2793  cobalt transport protein CbiM  63.64 
 
 
226 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1709  cobalamin biosynthesis protein CbiM  55.13 
 
 
248 aa  246  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2595  cobalt transport protein CbiM  64.09 
 
 
226 aa  245  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0918235  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2199  cobalt transport protein CbiM  56.09 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2245  cobalt transport protein CbiM  56.09 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.112187 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2192  cobalt transport protein CbiM  56.09 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2145  cobalt transport protein CbiM  56.09 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2358  cobalt transport protein CbiM  56.09 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.372857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1759  cobalt transport protein CbiM  65.75 
 
 
228 aa  241  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3589  cobalamin biosynthesis protein CbiM  58.18 
 
 
232 aa  238  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1266  cobalamin biosynthesis protein CbiM  51.67 
 
 
248 aa  236  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1861  cobalamin biosynthesis protein CbiM  62.39 
 
 
224 aa  235  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2145  cobalt transport protein CbiM  52.19 
 
 
235 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0808457  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  53.5 
 
 
250 aa  230  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0543  cobalamin biosynthesis protein CbiM  59.63 
 
 
226 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  57.49 
 
 
231 aa  226  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4719  cobalamin biosynthesis protein CbiM  60.65 
 
 
225 aa  225  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  56.42 
 
 
231 aa  224  8e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  54.63 
 
 
225 aa  224  8e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  59.3 
 
 
225 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2333  cobalt transport protein CbiM  54.9 
 
 
235 aa  223  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  58.29 
 
 
225 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  53.92 
 
 
229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  60.1 
 
 
229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  58.29 
 
 
225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1700  cobalt transport protein CbiM  53.67 
 
 
231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  59.31 
 
 
230 aa  208  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1216  cobalt transport protein CbiM  50.89 
 
 
231 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  50.97 
 
 
232 aa  204  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  52.4 
 
 
599 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0146  cobalt transport protein CbiM  51.53 
 
 
221 aa  189  4e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0185688  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0380  hypothetical protein  52.05 
 
 
259 aa  172  5e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  43.78 
 
 
245 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  44.29 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  41.31 
 
 
321 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  43.06 
 
 
251 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0472  cobalt transport protein CbiM  41.9 
 
 
225 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.55 
 
 
219 aa  106  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  38.17 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  38.81 
 
 
242 aa  97.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.24 
 
 
421 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  39.1 
 
 
352 aa  92  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  38.17 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.28 
 
 
232 aa  91.3  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  35.07 
 
 
239 aa  89  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  36.09 
 
 
330 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0330  cobalt transport protein CbiM  28.51 
 
 
325 aa  86.3  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  36.72 
 
 
230 aa  85.1  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11090  cobalt transport protein CbiM  36.03 
 
 
339 aa  81.6  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000340042  normal  0.0123253 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  31.25 
 
 
212 aa  79  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  30.77 
 
 
212 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.92 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4293  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.7 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  32.21 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.04 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.04 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.43 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.84 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  34.12 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.84 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.55 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0391  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.28 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.026574  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.33 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.16 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2134  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.69 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.77 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0062  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.85 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000311798  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  30.48 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.86 
 
 
328 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1793  cobalt transport protein CbiM  31.36 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000128429  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0213  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.28 
 
 
202 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.655003  normal  0.171707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.75 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.59 
 
 
213 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  30.94 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.34 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.83 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.59 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.83 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.83 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2033  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.96 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>