147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2033 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2033  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  100 
 
 
217 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2801  ABC type permease  54.88 
 
 
225 aa  186  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0062  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  43.81 
 
 
213 aa  181  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000311798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.91 
 
 
219 aa  159  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  36.7 
 
 
239 aa  148  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  39.07 
 
 
330 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11090  cobalt transport protein CbiM  40 
 
 
339 aa  144  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000340042  normal  0.0123253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  37.44 
 
 
230 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  37.5 
 
 
226 aa  135  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0330  cobalt transport protein CbiM  39.02 
 
 
325 aa  134  8e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  35.9 
 
 
242 aa  132  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  35.16 
 
 
226 aa  128  8.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  38.68 
 
 
352 aa  128  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.35 
 
 
421 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.4 
 
 
232 aa  122  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2305  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  44.6 
 
 
210 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1292  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.11 
 
 
299 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46518  normal  0.800906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0495  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM  43.93 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0528  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  45.5 
 
 
210 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0580281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.13 
 
 
216 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.85 
 
 
218 aa  92  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.64 
 
 
328 aa  92  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.16 
 
 
202 aa  91.7  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.12 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.88 
 
 
246 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.68 
 
 
229 aa  88.2  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.23 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4293  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.81 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0523  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  45.5 
 
 
210 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.354717  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.73 
 
 
241 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.17 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.32 
 
 
310 aa  84  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118647  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.73 
 
 
241 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0391  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.65 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.026574  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.78 
 
 
326 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  28.64 
 
 
235 aa  78.2  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0213  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.65 
 
 
202 aa  78.2  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.655003  normal  0.171707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1276  cobalamin biosynthesis protein CbiM  31.96 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.97 
 
 
307 aa  75.1  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  35.5 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  35.95 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  30.92 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1803  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.71 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3589  cobalamin biosynthesis protein CbiM  32.42 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  35 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.76 
 
 
306 aa  72  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  30.05 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  25.57 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2620  cobalt transport protein CbiM  36.72 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2145  cobalt transport protein CbiM  35.82 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0808457  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2601  cobalt transport protein CbiM  30.97 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184682  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1327  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.33 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.871033  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.55 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1793  cobalt transport protein CbiM  34.91 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000128429  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1060  cobalt transport protein CbiM  30.66 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.71 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2752  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30 
 
 
354 aa  69.3  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.71 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.71 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0543  cobalamin biosynthesis protein CbiM  33.49 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1216  cobalt transport protein CbiM  26.41 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  30.46 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0681  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.17 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1700  cobalt transport protein CbiM  30.88 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.76 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2595  cobalt transport protein CbiM  36 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0918235  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1402  cobalt transport protein CbiM  34.32 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  31.68 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2793  cobalt transport protein CbiM  36 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1351  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.58 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2352  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.18 
 
 
310 aa  64.3  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0560  cobalamin biosynthesis protein CbiM  30.67 
 
 
249 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0185  cobalt transport protein CbiM  30.97 
 
 
247 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.878644  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  33.59 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  31.58 
 
 
250 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  28.81 
 
 
321 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1222  cobalt transport protein CbiM  33.33 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.955789  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0182  cobalt transport protein CbiM  30.97 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  33.58 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1266  cobalamin biosynthesis protein CbiM  28.57 
 
 
248 aa  62.8  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  31.11 
 
 
251 aa  62.4  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0543  cobalt transport protein CbiM  37.39 
 
 
193 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1545  cobalt transport protein CbiM  36.72 
 
 
246 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221341  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0380  hypothetical protein  31.98 
 
 
259 aa  62  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  28.37 
 
 
250 aa  62  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  34.11 
 
 
232 aa  61.6  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1569  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.33 
 
 
233 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  29.77 
 
 
229 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3736  cobalamin biosynthesis protein CbiM  30.99 
 
 
251 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1709  cobalamin biosynthesis protein CbiM  33.88 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1805  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.94 
 
 
341 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423856  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  43.33 
 
 
599 aa  60.1  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  35.07 
 
 
230 aa  59.3  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  32.82 
 
 
225 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2134  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.01 
 
 
261 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  29.5 
 
 
245 aa  59.3  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1182  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.69 
 
 
331 aa  58.9  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00505251  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0927  cobalamin biosynthesis protein CbiM  30.88 
 
 
250 aa  58.9  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326506  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2199  cobalt transport protein CbiM  28.24 
 
 
245 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>