149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2801 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2801  ABC type permease  100 
 
 
225 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2033  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  54.88 
 
 
217 aa  206  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0062  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  44.02 
 
 
213 aa  180  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000311798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.64 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  31.31 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2305  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  50 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  33.51 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  32.24 
 
 
330 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  33.02 
 
 
230 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11090  cobalt transport protein CbiM  30.34 
 
 
339 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000340042  normal  0.0123253 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0495  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM  49.28 
 
 
210 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.68 
 
 
216 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.26 
 
 
232 aa  106  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  31.71 
 
 
226 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  32.6 
 
 
226 aa  105  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0528  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  50 
 
 
210 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0580281  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0330  cobalt transport protein CbiM  30.4 
 
 
325 aa  101  8e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  35.19 
 
 
352 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.19 
 
 
421 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.6 
 
 
204 aa  95.1  7e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4293  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  42.29 
 
 
230 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0523  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  50 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.354717  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0391  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.51 
 
 
202 aa  92.8  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.026574  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.59 
 
 
218 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.07 
 
 
246 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  31.07 
 
 
212 aa  89.4  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.47 
 
 
202 aa  88.6  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.88 
 
 
328 aa  88.6  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  30.1 
 
 
212 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.22 
 
 
326 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.09 
 
 
241 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.15 
 
 
310 aa  85.9  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118647  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.63 
 
 
241 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.09 
 
 
241 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1292  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.35 
 
 
299 aa  85.1  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46518  normal  0.800906 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.39 
 
 
229 aa  85.1  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.22 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0213  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.02 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.655003  normal  0.171707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1351  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.41 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  32.69 
 
 
210 aa  82  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  29.95 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.29 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  34.11 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1793  cobalt transport protein CbiM  35.29 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000128429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0993  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.46 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.24 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2134  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.97 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1327  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.3 
 
 
229 aa  72  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.871033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1803  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.33 
 
 
352 aa  72  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0543  cobalt transport protein CbiM  34.92 
 
 
193 aa  72  0.000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.66 
 
 
235 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.64 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.64 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.64 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.89 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0061  ABC-type transport system, permease component  36.36 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.43136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  32.74 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.29 
 
 
307 aa  68.6  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2352  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.73 
 
 
310 aa  68.6  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1279  cobalamin biosynthesis protein CbiM, putative  35.19 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0499926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1402  cobalt transport protein CbiM  33.33 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2752  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.14 
 
 
354 aa  65.5  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.61 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  30.05 
 
 
225 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0380  hypothetical protein  29.89 
 
 
259 aa  62.8  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1182  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.14 
 
 
331 aa  63.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00505251  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0681  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.3 
 
 
333 aa  62.4  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  29.58 
 
 
225 aa  62  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  29.58 
 
 
225 aa  61.6  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0712  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  41.03 
 
 
332 aa  62  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.218257  hitchhiker  0.00000357899 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2620  cobalt transport protein CbiM  31.34 
 
 
247 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  30.29 
 
 
229 aa  59.7  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  25.7 
 
 
235 aa  59.7  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1276  cobalamin biosynthesis protein CbiM  35.38 
 
 
246 aa  58.9  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  28.17 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  27.69 
 
 
231 aa  58.5  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1545  cobalt transport protein CbiM  31.82 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221341  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  30.07 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  30.64 
 
 
321 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.03 
 
 
355 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3837300000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3207  cobalt transport protein CbiM  35.81 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1222  cobalt transport protein CbiM  31.71 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.955789  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  29.05 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  31.52 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1060  cobalt transport protein CbiM  33.33 
 
 
254 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3947  cobalt transport protein CbiM  35.56 
 
 
205 aa  55.1  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0557  cobalt transport protein CbiM  36.04 
 
 
195 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.583466  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3589  cobalamin biosynthesis protein CbiM  30 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1243  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.72 
 
 
233 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000323865  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  30.72 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2595  cobalt transport protein CbiM  31.72 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0918235  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  28.15 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_004310  BR1365  cobalt transport protein CbiM  34.18 
 
 
211 aa  53.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1321  cobalt transport protein CbiM  34.18 
 
 
211 aa  53.1  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0185  cobalt transport protein CbiM  30.22 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.878644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0182  cobalt transport protein CbiM  30.22 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2022  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.45 
 
 
197 aa  52.4  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000920884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  29.09 
 
 
249 aa  52  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3736  cobalamin biosynthesis protein CbiM  32.17 
 
 
251 aa  51.6  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0171  cobalt transport protein CbiM  33.95 
 
 
194 aa  51.6  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>