128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0543 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0543  cobalamin biosynthesis protein CbiM  100 
 
 		 226 aa  427  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2793  cobalt transport protein CbiM  65.02 
 
 		 226 aa  277  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2595  cobalt transport protein CbiM  65.47 
 
 		 226 aa  272  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0918235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3589  cobalamin biosynthesis protein CbiM  68.66 
 
 		 232 aa  268  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4719  cobalamin biosynthesis protein CbiM  66.51 
 
 		 225 aa  265  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3660  cobalt transport protein CbiM  60.45 
 
 		 225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1697  cobalt transport protein CbiM  58.18 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.30926 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1222  cobalt transport protein CbiM  55.22 
 
 		 234 aa  234  8e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.955789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3736  cobalamin biosynthesis protein CbiM  55.5 
 
 		 251 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1241  cobalt transport protein CbiM  56.62 
 
 		 226 aa  230  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.335474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1226  cobalt transport protein CbiM  56.62 
 
 		 226 aa  229  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00004415  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  54.59 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2601  cobalt transport protein CbiM  55.96 
 
 		 246 aa  228  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184682  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1276  cobalamin biosynthesis protein CbiM  59.63 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0560  cobalamin biosynthesis protein CbiM  56.11 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1545  cobalt transport protein CbiM  54.88 
 
 		 246 aa  222  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221341  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0185  cobalt transport protein CbiM  52.51 
 
 		 247 aa  221  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.878644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0182  cobalt transport protein CbiM  51.6 
 
 		 247 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2620  cobalt transport protein CbiM  56.28 
 
 		 247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1060  cobalt transport protein CbiM  56.86 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0927  cobalamin biosynthesis protein CbiM  55.95 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326506  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  52.53 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  53.3 
 
 		 250 aa  215  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  50.46 
 
 		 250 aa  215  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  55.61 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1709  cobalamin biosynthesis protein CbiM  51.44 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1861  cobalamin biosynthesis protein CbiM  57.8 
 
 		 224 aa  207  9e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1266  cobalamin biosynthesis protein CbiM  49.3 
 
 		 248 aa  205  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3820  cobalt transport protein CbiM  53.95 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  48.58 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2199  cobalt transport protein CbiM  51.22 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2245  cobalt transport protein CbiM  51.22 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.112187 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2192  cobalt transport protein CbiM  51.22 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2145  cobalt transport protein CbiM  51.22 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2358  cobalt transport protein CbiM  51.22 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.372857 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2333  cobalt transport protein CbiM  49.53 
 
 		 235 aa  198  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1759  cobalt transport protein CbiM  55.16 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  46.85 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  51.77 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  52.25 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  47.27 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  44.2 
 
 		 232 aa  188  5e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1216  cobalt transport protein CbiM  45.7 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2145  cobalt transport protein CbiM  45.83 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0808457  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  50.23 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1700  cobalt transport protein CbiM  49.08 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  49.34 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  48.9 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  49.32 
 
 		 599 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  49.1 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0146  cobalt transport protein CbiM  48.11 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0185688  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0380  hypothetical protein  48.19 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  44.13 
 
 		 245 aa  141  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  44.6 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  40.95 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  40.09 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0472  cobalt transport protein CbiM  38.5 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.36 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.74 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11090  cobalt transport protein CbiM  36.84 
 
 		 339 aa  78.2  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000340042  normal  0.0123253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  37.31 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  33.85 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  31.82 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  39.85 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  28.57 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.05 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  35.11 
 
 		 330 aa  68.6  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  37.4 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  29.03 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.33 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.57 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.57 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.33 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.57 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.69 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  33.09 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.35 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  30.59 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  33.33 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0330  cobalt transport protein CbiM  31.82 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.91 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.09 
 
 		 307 aa  62  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.53 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.57 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.53 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  31.01 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.12 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2134  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.84 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.59 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1351  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.97 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.94 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118647  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  29.41 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.83 
 
 		 421 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.64 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.59 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.79 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2033  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.49 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0062  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.23 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000311798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.85 
 
 		 326 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>