More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0693 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
104 aa  205  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  78.85 
 
 
104 aa  175  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  60.78 
 
 
105 aa  129  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  9.21122e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  63 
 
 
100 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  63 
 
 
100 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  55.88 
 
 
101 aa  119  1e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  54.81 
 
 
100 aa  117  5e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  56.31 
 
 
110 aa  115  2e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  59 
 
 
100 aa  108  2e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  55.34 
 
 
100 aa  107  4e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  58 
 
 
100 aa  108  4e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  56.31 
 
 
100 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  52.48 
 
 
100 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  48.54 
 
 
103 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  48.54 
 
 
103 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 
97 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  50.5 
 
 
100 aa  98.6  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  51.58 
 
 
100 aa  97.8  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  53.41 
 
 
95 aa  91.7  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  6.05336e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
98 aa  89.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  2.10962e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
94 aa  87.8  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  49.38 
 
 
95 aa  87.4  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  51.22 
 
 
96 aa  84  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  48.24 
 
 
94 aa  83.6  1e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 
98 aa  82.4  2e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 
97 aa  82  2e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  6.52343e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  44.94 
 
 
99 aa  82  2e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  52.56 
 
 
117 aa  80.9  5e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.54231e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  46.84 
 
 
95 aa  80.5  7e-15  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  51.72 
 
 
98 aa  80.1  9e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 
94 aa  79.7  1e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  44.19 
 
 
95 aa  79  2e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.40996e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 
98 aa  79  2e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  40.48 
 
 
91 aa  79  2e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.64247e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  40.48 
 
 
91 aa  79  2e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.27953e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  48.15 
 
 
98 aa  78.6  2e-14  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 
98 aa  79  2e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 
98 aa  78.6  2e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 
94 aa  79.3  2e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  2.64859e-05 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  45.12 
 
 
95 aa  78.6  3e-14  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 
97 aa  77.8  5e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 
97 aa  77.8  5e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  49.38 
 
 
96 aa  77.4  6e-14  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  48.15 
 
 
97 aa  77  7e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 
97 aa  77  8e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  46.91 
 
 
97 aa  76.6  1e-13  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  46.91 
 
 
97 aa  76.6  1e-13  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 
95 aa  76.3  1e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  45.78 
 
 
95 aa  76.6  1e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  46.34 
 
 
98 aa  76.6  1e-13  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  40.48 
 
 
91 aa  75.9  2e-13  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  43.37 
 
 
97 aa  75.1  3e-13  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 
95 aa  75.1  3e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.50147e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  48.19 
 
 
98 aa  75.1  3e-13  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  43.37 
 
 
97 aa  75.1  3e-13  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  44.21 
 
 
109 aa  74.7  4e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  45.12 
 
 
98 aa  74.7  4e-13  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  45.68 
 
 
97 aa  74.3  5e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  45.35 
 
 
95 aa  74.3  5e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.41418e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  45.45 
 
 
95 aa  74.3  5e-13  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  1.09599e-08 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  43.53 
 
 
97 aa  74.3  5e-13  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  45.68 
 
 
97 aa  74.3  5e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  48.19 
 
 
99 aa  73.9  7e-13  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  2.5981e-07  hitchhiker  4.76583e-07 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 
98 aa  73.6  9e-13  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.28717e-28 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  40.48 
 
 
98 aa  72.8  1e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  44.19 
 
 
95 aa  73.2  1e-12  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  40.23 
 
 
98 aa  73.2  1e-12  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 
94 aa  72.8  1e-12  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
100 aa  72.4  2e-12  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  4.09295e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  42.05 
 
 
98 aa  72.4  2e-12  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  45.78 
 
 
97 aa  72.4  2e-12  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.43862e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  45.78 
 
 
97 aa  72.4  2e-12  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.42276e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 
98 aa  72  2e-12  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  45.12 
 
 
94 aa  72  2e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  40.86 
 
 
100 aa  72.4  2e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
99 aa  72  2e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
100 aa  72.4  2e-12  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.1109e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  40.48 
 
 
98 aa  71.6  3e-12  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.24124e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  48.15 
 
 
104 aa  71.6  3e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  43.9 
 
 
96 aa  72  3e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 
99 aa  72  3e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  45.68 
 
 
113 aa  71.6  3e-12  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  45.98 
 
 
103 aa  71.2  4e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  38.64 
 
 
98 aa  71.2  4e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  45.68 
 
 
97 aa  71.2  4e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  42.05 
 
 
96 aa  70.9  5e-12  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  47.5 
 
 
97 aa  70.9  5e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.85087e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  44.19 
 
 
93 aa  71.2  5e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 
98 aa  70.9  6e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  46.67 
 
 
101 aa  70.9  6e-12  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  5.94054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  45.68 
 
 
97 aa  70.9  6e-12  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 
98 aa  70.5  7e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 
99 aa  70.5  7e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  40.45 
 
 
96 aa  70.5  8e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 
99 aa  70.5  8e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 
96 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  2.62494e-10  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 
96 aa  69.7  1e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.56815e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 
96 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  2.63853e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 
96 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.88654e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 
96 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>