More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3423 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  86.35 
 
 		 521 aa  839    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 498 aa  964    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  62.96 
 
 		 491 aa  560  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  63.29 
 
 		 470 aa  535  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.56 
 
 		 470 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.98 
 
 		 471 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.98 
 
 		 471 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  59.75 
 
 		 486 aa  528  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.98 
 
 		 471 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  56.91 
 
 		 488 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  62.39 
 
 		 479 aa  505  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.02 
 
 		 506 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.58 
 
 		 491 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.87 
 
 		 515 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  54.39 
 
 		 487 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  50.92 
 
 		 494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.78 
 
 		 491 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.33 
 
 		 518 aa  444  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.86 
 
 		 517 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.35 
 
 		 481 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.83 
 
 		 480 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  52.17 
 
 		 484 aa  432  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.12 
 
 		 490 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.46 
 
 		 475 aa  430  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  50.2 
 
 		 493 aa  425  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.28 
 
 		 490 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.3 
 
 		 488 aa  415  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.24 
 
 		 507 aa  415  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.06 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  47.28 
 
 		 502 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.83 
 
 		 463 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.44 
 
 		 484 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  50.31 
 
 		 496 aa  381  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.35 
 
 		 483 aa  382  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.15 
 
 		 480 aa  349  5e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.84 
 
 		 496 aa  327  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.61 
 
 		 465 aa  317  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  41.77 
 
 		 456 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.56 
 
 		 456 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.8 
 
 		 460 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.51 
 
 		 442 aa  297  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.35 
 
 		 456 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.31 
 
 		 466 aa  284  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.58 
 
 		 440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.12 
 
 		 433 aa  264  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.97 
 
 		 437 aa  264  3e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  34.99 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.02 
 
 		 431 aa  260  4e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.17 
 
 		 453 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.33 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.54 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.47 
 
 		 471 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0281  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.42 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681236  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.34 
 
 		 444 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.34 
 
 		 444 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.1 
 
 		 438 aa  253  6e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.23 
 
 		 462 aa  253  8.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.41 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  36.07 
 
 		 445 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  36.07 
 
 		 445 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  36.07 
 
 		 445 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  36.07 
 
 		 445 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.72 
 
 		 428 aa  249  8e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  35.9 
 
 		 442 aa  249  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  35.9 
 
 		 442 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.9 
 
 		 442 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.46 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.76 
 
 		 457 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.97 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.24 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  33.83 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.24 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.52 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.11 
 
 		 429 aa  246  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.94 
 
 		 441 aa  246  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0021  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.56 
 
 		 445 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.395104 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2711  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.2 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172353  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.12 
 
 		 463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1611  xanthine/uracil permease family protein  36.46 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0727  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.27 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.96 
 
 		 446 aa  243  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  32.5 
 
 		 467 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4183  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.1 
 
 		 438 aa  243  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.851751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.69 
 
 		 441 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.55 
 
 		 430 aa  242  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5145  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  36.19 
 
 		 445 aa  242  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.164927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03598  predicted inner membrane protein  35.98 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4253  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.5 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  35.48 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03542  hypothetical protein  35.98 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4143  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.48 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4223  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.98 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4280  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.98 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3928  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.98 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3244  xanthine/uracil/vitamin C permease  32.32 
 
 		 461 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4081  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.98 
 
 		 445 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.74 
 
 		 438 aa  239  6.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  34.91 
 
 		 429 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  32.45 
 
 		 465 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.37 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>