195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3347 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 228 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  96.93 
 
 		 228 aa  447  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  78.18 
 
 		 225 aa  355  2.9999999999999997e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2747  TrkA-N domain protein  62.33 
 
 		 235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0359063  hitchhiker  0.0000719315 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  64.68 
 
 		 221 aa  282  3.0000000000000004e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06980  K+ transport system, NAD-binding component  60.43 
 
 		 232 aa  277  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0505  TrkA-N domain protein  60 
 
 		 254 aa  271  8.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  58.64 
 
 		 225 aa  270  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3270  TrkA-N domain protein  58.01 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  55.05 
 
 		 224 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  54.84 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  55.19 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  49.76 
 
 		 230 aa  228  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  54.07 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  49.29 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  50.23 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  53.33 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  51.83 
 
 		 222 aa  221  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  52.56 
 
 		 220 aa  221  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  50.95 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  51.2 
 
 		 213 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  50.47 
 
 		 222 aa  216  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  51.82 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24440  K+ transport system, NAD-binding component  49.07 
 
 		 222 aa  208  7e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.800738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0796  Trk-type K+ transport systems membrane component  44.19 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  48.39 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  48.36 
 
 		 222 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  42.31 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  38.86 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  38.86 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  38.65 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  38.16 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  38.16 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  38.16 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  38.16 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  38.16 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  38.16 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  38.16 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  38.16 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  38.16 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  38.16 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  38.28 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  36.67 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  37.98 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  36.23 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  36.68 
 
 		 220 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  34.43 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  36.54 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  36.54 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  41.15 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  39.2 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  36.54 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  34.78 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  36.97 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  40.19 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  35.07 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  34.29 
 
 		 233 aa  135  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  36.49 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  33.49 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  35.32 
 
 		 218 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  30.33 
 
 		 217 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  31.84 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0750  TrkA domain-containing protein  38.55 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.803573  normal  0.253071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  34.45 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  31.75 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  33.49 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  34.91 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  35.85 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  32.54 
 
 		 229 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  32.54 
 
 		 229 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  31.9 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  33.5 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  33.01 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  29.67 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  36.52 
 
 		 217 aa  118  9e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  32.35 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  31.68 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  31.75 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  39.38 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0630  TrkA-N domain protein  37.25 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.208337  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  31.4 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  33.33 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  35.63 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  30 
 
 		 217 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0728  TrkA-N domain protein  31.75 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.439731  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2522  TrkA domain-containing protein  38.71 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000136868  normal  0.0316786 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4480  TrkA domain-containing protein  29.52 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000127966 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1793  TrkA-N domain protein  32.08 
 
 		 220 aa  102  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  30.52 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4281  potassium uptake protein KtrA, putative  36.36 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1642  hypothetical protein  38.02 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0050  TrkA domain-containing protein  34.69 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0055  TrkA domain-containing protein  31 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000827601 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  29.86 
 
 		 217 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  28.92 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0294  TrkA domain-containing protein  29.15 
 
 		 245 aa  99  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4040  TrkA-N domain protein  31.43 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0050  TrkA domain-containing protein  28.89 
 
 		 232 aa  98.6  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0058  TrkA domain-containing protein  28.89 
 
 		 232 aa  98.6  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000170567 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>