153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0294 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0294  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
245 aa  483  1e-135  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0749  lectin  32.28 
 
 
260 aa  148  6e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.84941  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  31.28 
 
 
218 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  31.31 
 
 
221 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  31.31 
 
 
221 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  31.31 
 
 
221 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  31.31 
 
 
221 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  31.31 
 
 
221 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  31.31 
 
 
221 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  31.31 
 
 
221 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  31.31 
 
 
221 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  31.31 
 
 
221 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  31.31 
 
 
221 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  31.31 
 
 
221 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  29.58 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  30.48 
 
 
220 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  29.46 
 
 
221 aa  113  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  28.91 
 
 
218 aa  111  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  30.58 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  28.04 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 
215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  28.5 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  27.57 
 
 
219 aa  109  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  27.1 
 
 
220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  27.1 
 
 
220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  31.46 
 
 
220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  29.41 
 
 
227 aa  108  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  26.85 
 
 
221 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  26.85 
 
 
221 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  26.19 
 
 
217 aa  106  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  29.17 
 
 
218 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  28.91 
 
 
215 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  24.77 
 
 
223 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  26.76 
 
 
222 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  26.32 
 
 
222 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  29.05 
 
 
217 aa  102  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  27.23 
 
 
223 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  27.4 
 
 
217 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  29.25 
 
 
220 aa  99.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  29.15 
 
 
228 aa  99  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  26.79 
 
 
216 aa  98.2  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  24.65 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  29.15 
 
 
228 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  25.58 
 
 
224 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  28.57 
 
 
225 aa  97.8  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  29.61 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  28.5 
 
 
233 aa  97.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  26.42 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0137  TRK system potassium uptake protein TrkA, putative  27.65 
 
 
213 aa  96.3  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  24.17 
 
 
224 aa  95.1  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  28.17 
 
 
219 aa  94.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  27.17 
 
 
222 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  27.62 
 
 
233 aa  94  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1642  hypothetical protein  26.34 
 
 
216 aa  94.4  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  24.76 
 
 
220 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  23.81 
 
 
224 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  27.36 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1793  TrkA-N domain protein  25.74 
 
 
220 aa  92.8  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  28.1 
 
 
220 aa  92.4  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  31.46 
 
 
250 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  24 
 
 
224 aa  91.7  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1476  potassium uptake protein TrkA, putative  29.11 
 
 
216 aa  91.7  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1301  potassium uptake protein TrkA, putative  29.11 
 
 
216 aa  91.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1463  TrkA-N domain protein  26.54 
 
 
220 aa  91.3  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00504118  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0439  putative potassium uptake protein TrkA  29.11 
 
 
216 aa  91.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00941  VIC family potassium channel protein  29.17 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  26.57 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0052  TrkA domain-containing protein  25.91 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000156349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0050  TrkA domain-containing protein  25.45 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0058  TrkA domain-containing protein  25.45 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000170567 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  27.14 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1833  TrkA-N domain protein  27.06 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  26.42 
 
 
231 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  26.42 
 
 
231 aa  89.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1834  TrkA-N  24.66 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.423842  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  27.36 
 
 
229 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  25 
 
 
217 aa  89.7  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  27.36 
 
 
229 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  27.36 
 
 
232 aa  89  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  25.7 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4040  TrkA-N domain protein  23.79 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0379  VIC family potassium channel protein  30.43 
 
 
234 aa  87  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  28.99 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  24.29 
 
 
213 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0350  K+ transport system, NAD-binding component  27.91 
 
 
223 aa  87  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.53262  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0050  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0055  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.00000827601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4304  TrkA domain-containing protein  25.45 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.333456  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0054  TrkA-N domain protein  25.45 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1449  putative potassium channel, VIC family  28.11 
 
 
234 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.286988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  25.24 
 
 
220 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01511  VIC family potassium channel protein  28.11 
 
 
234 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  26.05 
 
 
225 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  26.42 
 
 
231 aa  85.1  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  26.9 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  22.38 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02541  putative potassium channel, VIC family  28.71 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  26.16 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0047  TrkA domain-containing protein  28.05 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  22.75 
 
 
230 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458769 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>