227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0015 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0015  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
728 aa  1486  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  9.73096e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0014  extracellular solute-binding protein family 5  59.97 
 
 
714 aa  918  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.021356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  24.54 
 
 
575 aa  87.8  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1071  peptide ABC transporter, peptide-binding protein OppA  24.94 
 
 
591 aa  84  8e-15  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  4.08917e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 
575 aa  79  3e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 
575 aa  78.6  4e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  30.59 
 
 
579 aa  78.6  4e-13  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.06 
 
 
575 aa  77.8  7e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 
591 aa  77.8  7e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 
591 aa  76.6  2e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.95 
 
 
559 aa  75.9  3e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.88 
 
 
575 aa  75.9  3e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 
567 aa  75.1  4e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  30.28 
 
 
580 aa  75.1  4e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  24.51 
 
 
575 aa  75.1  5e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.18 
 
 
575 aa  74.7  6e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.81 
 
 
555 aa  74.3  7e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.13 
 
 
593 aa  74.3  8e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.13 
 
 
593 aa  74.3  8e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.13 
 
 
593 aa  74.3  8e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.13 
 
 
593 aa  73.6  1e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.13 
 
 
593 aa  73.6  1e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.87 
 
 
593 aa  73.2  2e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  30.9 
 
 
566 aa  72.8  2e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  24.12 
 
 
575 aa  73.2  2e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  30.47 
 
 
567 aa  72.4  3e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  23.12 
 
 
575 aa  70.5  1e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.75 
 
 
592 aa  69.7  2e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  23.28 
 
 
557 aa  67.8  7e-10  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1009  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 
571 aa  65.9  3e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  30.81 
 
 
579 aa  65.5  3e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  4.49992e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2906  extracellular solute-binding protein family 5  22.6 
 
 
574 aa  65.9  3e-09  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0990  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 
571 aa  65.9  3e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  23.64 
 
 
593 aa  63.9  9e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 
593 aa  61.6  5e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3270  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 
567 aa  61.6  5e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3271  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
571 aa  59.3  2e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499057  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2203  extracellular solute-binding protein family 5  22.97 
 
 
531 aa  59.3  2e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3603  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  26.46 
 
 
563 aa  58.2  5e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.188296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3345  ABC transporter substrate-binding protein  26.56 
 
 
570 aa  58.2  6e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0921208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3596  oligopeptide transporter, periplasmic-binding protein  26.56 
 
 
570 aa  58.2  6e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.66683e-08 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3695  oligopeptide-binding protein OppA  28.02 
 
 
571 aa  58.2  6e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00658046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3608  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.86 
 
 
568 aa  56.6  1e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3601  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  27.48 
 
 
568 aa  56.6  2e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3696  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  35.54 
 
 
567 aa  56.6  2e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00571455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3291  methyltransferase  27.48 
 
 
568 aa  55.8  3e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.672963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3377  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.48 
 
 
568 aa  55.8  3e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0900205  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1116  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 
592 aa  55.8  3e-06  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3642  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.48 
 
 
568 aa  55.8  3e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3611  oligopeptide transporter, periplasmic-binding protein  25.67 
 
 
570 aa  55.5  4e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436293  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.7 
 
 
542 aa  54.7  6e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0691  extracellular solute-binding protein family 5  21.23 
 
 
600 aa  54.7  7e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3293  ABC transporter substrate-binding protein  26.17 
 
 
567 aa  54.3  8e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00121991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3379  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.46 
 
 
562 aa  54.3  8e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3645  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.46 
 
 
562 aa  54.3  8e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1621  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.71 
 
 
567 aa  54.3  8e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00066622  hitchhiker  0.00438067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0187  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 
529 aa  54.3  9e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  1.20375e-06 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0728  extracellular solute-binding protein family 5  28.82 
 
 
535 aa  53.9  9e-06  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2243  extracellular solute-binding protein  35.2 
 
 
563 aa  54.3  9e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00498684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  23.62 
 
 
560 aa  53.9  9e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.33 
 
 
511 aa  53.5  1e-05  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5193  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
529 aa  53.5  1e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0587295  normal  0.27415 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3609  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.54 
 
 
568 aa  53.9  1e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0365619  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1578  extracellular solute-binding protein  22.1 
 
 
595 aa  53.5  1e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.259952  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0937  extracellular solute-binding protein  21.36 
 
 
586 aa  52.8  2e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3602  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  26.15 
 
 
568 aa  52.8  2e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0564  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 
607 aa  52.8  2e-05  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  1.0438e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1623  oligopeptide-binding protein OppA  32.35 
 
 
515 aa  52.4  3e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00720948  normal  0.060684 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 
529 aa  52  3e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 
530 aa  52.4  3e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 
529 aa  52.4  3e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3595  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.4 
 
 
568 aa  52  4e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.63174e-05 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  29.52 
 
 
529 aa  52  4e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3344  ABC transporter, substrate-binding protein  34.4 
 
 
568 aa  52  4e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.331453  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3644  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  34.4 
 
 
568 aa  52  4e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.257621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3378  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  34.4 
 
 
568 aa  52  4e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  21.58 
 
 
573 aa  51.6  5e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3292  ABC transporter, substrate-binding protein  26.92 
 
 
568 aa  51.6  5e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000166709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3272  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 
567 aa  51.6  5e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00124689  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  29.6 
 
 
588 aa  51.2  7e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1089  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 
551 aa  50.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000272386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.36 
 
 
543 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  30.36 
 
 
558 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  9.00492e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4108  oligopeptide-binding protein OppA  32.56 
 
 
551 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  27.93 
 
 
584 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1234  oligopeptide-binding protein OppA  32.56 
 
 
551 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.576068  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  29.27 
 
 
562 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.36 
 
 
543 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.36 
 
 
558 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.36 
 
 
558 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00641  ABC oligopeptide transporter periplasmic component  27.63 
 
 
609 aa  49.7  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 
558 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  2.1243e-06 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  30.36 
 
 
543 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  30.36 
 
 
543 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  31.78 
 
 
589 aa  49.3  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1089  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  31.45 
 
 
548 aa  48.9  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.231521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0216  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 
553 aa  49.3  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.923383 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  22.72 
 
 
565 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1083  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  31.45 
 
 
548 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00147286  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1107  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  32.14 
 
 
534 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>