79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0033 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_0033  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 		 415 aa  833    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.744264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0032  membrane protein  57.84 
 
 		 407 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0047  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  57.07 
 
 		 407 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0035  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  57.07 
 
 		 407 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3521  long-chain fatty acid transport protein, outer membrane protein  27.23 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04350  outer membrane protein P1, putative  26.95 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0256286  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0470  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2174  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.86 
 
 		 410 aa  97.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3234  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.77 
 
 		 420 aa  94  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2044  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.39 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00212006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1800  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.79 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.839799  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2013  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  23.73 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3004  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.68 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0035  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.62 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3370  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.37 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0068  aromatic hydrocarbon degradation protein  24.15 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.952244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1588  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.08 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000227474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0065  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.55 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.709413 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1313  aromatic hydrocarbon degradation protein  21.8 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0891  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.5 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00668397  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2708  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.92 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1758  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.49 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.407775  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0134  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.45 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512951  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1993  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.41 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.131408  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1252  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.98 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000958296  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1585  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.72 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002851  long-chain fatty acid transport protein  22.54 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1710  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.31 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3059  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.6 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292585  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0135  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.33 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4441  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.62 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526852 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1410  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  19.86 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.343268  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0339  OMPP1/FadL/TodX family outer membrane protein  23.12 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.746595  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2596  long chain fatty acid transport protein  24.18 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0488563  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0350  aromatic hydrocarbon degradation protein  22.6 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000805243 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.66 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1551  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.43 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0286516  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0104  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.19 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1379  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.58 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.918562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0246  membrane protein  22.15 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03125  hypothetical protein  21.08 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1669  membrane protein  22.6 
 
 		 427 aa  57  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1767  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.7 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0166103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2658  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.65 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000308676  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0560  long-chain fatty acid transport protein  21.45 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00871251  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1834  hypothetical protein  22.25 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0420265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3634  long-chain fatty acid transport protein  23.59 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000535062  hitchhiker  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1772  outer membrane protein transport protein (ompp1/fadl/todx)  22.03 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000672167  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3092  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.06 
 
 		 450 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3046  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.77 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3082  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.07 
 
 		 416 aa  53.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000123053  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2706  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.8 
 
 		 400 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.327378  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1804  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.02 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal  0.581648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1720  outer membrane protein  23.28 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0182152  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5229  outer membrane protein  21.66 
 
 		 482 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0539  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23 
 
 		 488 aa  51.6  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2250  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.45 
 
 		 407 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1488  outer membrane protein transport protein (OMPP1/FadL/TodX)  22.6 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000022561  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2562  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.02 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000928224  hitchhiker  0.000000000130731 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3896  hypothetical protein  27.78 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1655  aromatic hydrocarbon degradation protein  21.3 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0166252  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5070  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.62 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0344553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60730  putative outer membrane protein  20.23 
 
 		 463 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2270  outer membrane protein transport protein  21.93 
 
 		 438 aa  47.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000125338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0428  OMPP1/FadL/TodX family toluene transport protein  21.96 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000260266  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1287  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.84 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102696  normal  0.683767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1689  aromatic hydrocarbon degradation protein  22.33 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918972  normal  0.897129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4232  long-chain fatty acid transport protein  20.98 
 
 		 437 aa  47  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3669  aromatic hydrocarbon degradation protein  22.41 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832534  normal  0.097076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3994  long-chain fatty acid ABC transporter  21.74 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4038  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.19 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.813812  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1288  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.86 
 
 		 565 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2884  long-chain fatty acid outer membrane transporter  19.5 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576882  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1245  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.6 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4491  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.44 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3997  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.9 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1548  aromatic hydrocarbon degradation protein  22.14 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000033121  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2482  aromatic hydrocarbon degradation protein  22.49 
 
 		 423 aa  43.5  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3342  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.81 
 
 		 436 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15331  normal  0.989492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>