67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3762 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  100 
 
 		 376 aa  740    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  66.02 
 
 		 256 aa  339  5e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  57.88 
 
 		 330 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  46.54 
 
 		 316 aa  296  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  55.43 
 
 		 317 aa  295  7e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  52.17 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  56 
 
 		 323 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  57.36 
 
 		 261 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  50.66 
 
 		 335 aa  268  8e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  50 
 
 		 324 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  48.45 
 
 		 262 aa  253  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  46.61 
 
 		 257 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  44.36 
 
 		 259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  49.58 
 
 		 259 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  45.28 
 
 		 261 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  44.75 
 
 		 259 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1506  SpoOM family protein  46.88 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118009  hitchhiker  0.00241219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  42.64 
 
 		 256 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  43.63 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  38.28 
 
 		 254 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  37.21 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1411  SpoOM family protein  33.72 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1370  SpoOM family protein  34.5 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  34.19 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  32.43 
 
 		 254 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  33.33 
 
 		 247 aa  112  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  33.05 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  31.13 
 
 		 254 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  30.2 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  28.87 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  29.39 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  29.39 
 
 		 251 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  30.17 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  29.8 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  29.8 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  29.8 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  29.75 
 
 		 246 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  29.8 
 
 		 251 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  32.41 
 
 		 248 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  29.75 
 
 		 246 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  31.13 
 
 		 241 aa  99.8  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  29.67 
 
 		 252 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  29.67 
 
 		 252 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  27.35 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  30.22 
 
 		 268 aa  86.3  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  29.66 
 
 		 268 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2480  SpoOM-related protein  29.65 
 
 		 280 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  29.44 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1070  SpoOM family protein  28.38 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3245  SpoOM family protein  27.56 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0048  putative sporulation-control protein  27.49 
 
 		 261 aa  72  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0812821  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  38.73 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1266  SpoOM family protein  28.57 
 
 		 132 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000350591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0764  hypothetical protein  38.16 
 
 		 228 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5623  hypothetical protein  54.55 
 
 		 778 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00516948  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04595  An-Nup2 Nuclear pore complex protein (Eurofung)  38.83 
 
 		 512 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  43.33 
 
 		 514 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2148  SpoOM family protein  28.57 
 
 		 133 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  39.66 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  39.66 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  39.66 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  39.66 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  39.66 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  39.66 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  39.66 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0616  hypothetical protein  42.19 
 
 		 712 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  39.34 
 
 		 1198 aa  43.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>