More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0013 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
182 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  77.9 
 
 
182 aa  266  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  71.6 
 
 
181 aa  248  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  71.01 
 
 
187 aa  245  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  64.37 
 
 
175 aa  234  5e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  67.4 
 
 
182 aa  232  2e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  63.47 
 
 
177 aa  229  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  69.36 
 
 
176 aa  228  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  62.07 
 
 
175 aa  225  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  70.66 
 
 
176 aa  224  5e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  72.46 
 
 
182 aa  222  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  71.18 
 
 
175 aa  221  5e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  71.18 
 
 
175 aa  221  5e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  71.18 
 
 
175 aa  221  5e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  68.6 
 
 
173 aa  220  1e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  71.08 
 
 
178 aa  219  2e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  61.36 
 
 
179 aa  217  8e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  70.41 
 
 
170 aa  216  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  64.67 
 
 
206 aa  216  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  71.86 
 
 
177 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  62.13 
 
 
173 aa  214  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  60.23 
 
 
174 aa  215  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  58.86 
 
 
176 aa  214  7e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  59.09 
 
 
179 aa  212  3e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  60.69 
 
 
181 aa  211  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  59.54 
 
 
181 aa  206  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.77678e-13 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  60.12 
 
 
174 aa  206  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  58.99 
 
 
178 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  59.46 
 
 
193 aa  201  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  64.29 
 
 
170 aa  199  2e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  63.64 
 
 
179 aa  198  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  64.91 
 
 
177 aa  194  5e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  60.56 
 
 
184 aa  193  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  56.65 
 
 
176 aa  190  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  60 
 
 
176 aa  186  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  60.23 
 
 
179 aa  184  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  53.14 
 
 
178 aa  182  2e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  55.36 
 
 
176 aa  180  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  55.36 
 
 
188 aa  179  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  52.35 
 
 
172 aa  179  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  60.48 
 
 
180 aa  177  6e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  51.76 
 
 
172 aa  176  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  53.57 
 
 
188 aa  173  1e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  53.72 
 
 
189 aa  171  6e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  59.52 
 
 
172 aa  167  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  50.89 
 
 
287 aa  167  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  60.48 
 
 
228 aa  167  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  52.05 
 
 
376 aa  167  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  46.7 
 
 
241 aa  165  3e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  51.79 
 
 
378 aa  162  2e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  56.76 
 
 
310 aa  161  5e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.15 
 
 
201 aa  160  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  49.41 
 
 
657 aa  159  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.59 
 
 
310 aa  158  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  49.41 
 
 
266 aa  155  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  55.41 
 
 
310 aa  154  5e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  61.31 
 
 
168 aa  151  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  59.42 
 
 
168 aa  151  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  49.11 
 
 
665 aa  150  8e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  49.7 
 
 
372 aa  149  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  49.1 
 
 
174 aa  149  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  47.34 
 
 
571 aa  148  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  58.7 
 
 
168 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  58.7 
 
 
168 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  52 
 
 
357 aa  144  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  51.19 
 
 
164 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  47.06 
 
 
376 aa  142  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  42.2 
 
 
629 aa  141  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  57.42 
 
 
322 aa  140  9e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  50.6 
 
 
164 aa  139  2e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2158  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.66 
 
 
218 aa  138  4e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  42.93 
 
 
197 aa  137  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  46.24 
 
 
181 aa  137  6e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  52.03 
 
 
163 aa  136  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.35 
 
 
468 aa  135  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  50.99 
 
 
164 aa  136  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0969  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.71 
 
 
196 aa  135  3e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  47.34 
 
 
629 aa  135  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18195  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  44.19 
 
 
160 aa  135  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896835  normal  0.71444 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75268  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CPR6 (PPIase) (Rotamase)  48.45 
 
 
366 aa  133  1e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.681927  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  47.34 
 
 
172 aa  133  1e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  46.24 
 
 
254 aa  132  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  5.98862e-05 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1651  peptidylprolyl isomerase  53.33 
 
 
223 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.321717  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  42.62 
 
 
254 aa  132  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  50.29 
 
 
179 aa  132  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  54.42 
 
 
167 aa  132  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  45.71 
 
 
573 aa  131  4e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1859  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  52.03 
 
 
197 aa  131  4e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  3.17427e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  46.43 
 
 
178 aa  130  9e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  46.62 
 
 
202 aa  130  1e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7102  predicted protein  51.23 
 
 
164 aa  130  1e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0596707 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04583  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D (PPIase D)(Rotamase D)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4E7]  51.27 
 
 
372 aa  129  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0519322  normal  0.28877 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_13387  predicted protein  54.14 
 
 
169 aa  129  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.618265 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  48.98 
 
 
161 aa  129  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0540  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  38.94 
 
 
197 aa  129  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1981  Peptidylprolyl isomerase  47.73 
 
 
222 aa  128  4e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2207  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.37 
 
 
230 aa  127  8e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2295  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.37 
 
 
230 aa  127  8e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3653  Peptidylprolyl isomerase  47.3 
 
 
247 aa  127  9e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.57501e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0729  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  53.47 
 
 
167 aa  127  1e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>