More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0556 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
349 aa  703    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  45.21 
 
 
727 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 
358 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 
321 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
318 aa  135  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 
597 aa  122  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
398 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 
294 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  35.32 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  32.7 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
302 aa  114  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
581 aa  112  8.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
1250 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  34 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.78 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 
358 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.17 
 
 
295 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
310 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
327 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
333 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
347 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
1007 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.16 
 
 
312 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
386 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 
380 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  30.35 
 
 
309 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
325 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 
353 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
307 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
390 aa  106  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 
305 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
300 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  31 
 
 
334 aa  105  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00201  glycosyl transferase  34.09 
 
 
316 aa  105  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1747  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
352 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.94845  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
306 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
338 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
333 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 
254 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
344 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  30.7 
 
 
302 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 
276 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
347 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  30.86 
 
 
341 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
361 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
344 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 
390 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
336 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2369  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
335 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
347 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
365 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
347 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
316 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
324 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.12 
 
 
266 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
300 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  30.19 
 
 
300 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
280 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  32.57 
 
 
299 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
294 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 
274 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4802  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
373 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858117  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  33.33 
 
 
330 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
299 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
310 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.55 
 
 
266 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.22 
 
 
466 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
397 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2458  glycosyl transferase family 2  28.73 
 
 
340 aa  99.8  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00372639  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
351 aa  99.4  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.63 
 
 
294 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  31.63 
 
 
294 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
337 aa  99.4  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.64 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.36 
 
 
266 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.36 
 
 
266 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.14 
 
 
266 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  36.36 
 
 
266 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  30.8 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
289 aa  99  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
357 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
280 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
287 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 
1252 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 
379 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 
1252 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
363 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.19 
 
 
321 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
301 aa  97.1  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>