53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0093 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0093  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  343  8e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  38.69 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2616  hypothetical protein  33.16 
 
 		 239 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  32.72 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  29.48 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  31.87 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  35.25 
 
 		 360 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  28.65 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  29.51 
 
 		 196 aa  52  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  28.81 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6418  protein of unknown function UPF0016  31.03 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00518335  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  28.41 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0022  protein of unknown function UPF0016  34.29 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  29.94 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  26.59 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  29.89 
 
 		 256 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  29.14 
 
 		 221 aa  48.9  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  31.03 
 
 		 238 aa  47.8  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2497  hypothetical protein  29.2 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  40.86 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  28.26 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  27.37 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  28.87 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  27.17 
 
 		 215 aa  45.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  30.27 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  30.06 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0157  protein of unknown function UPF0016  32.65 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  27.85 
 
 		 196 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  29.28 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  27.97 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  29.59 
 
 		 192 aa  44.3  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  31.16 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  28.12 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  27.12 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  29.59 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  28.73 
 
 		 261 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  36.99 
 
 		 90 aa  43.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  27.53 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  27.89 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  28.07 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  25.7 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  32.61 
 
 		 270 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  29.75 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  26.55 
 
 		 204 aa  42  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  30.73 
 
 		 188 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  28.78 
 
 		 194 aa  42  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  28.78 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  27.84 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  27.84 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  27.22 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  25.75 
 
 		 185 aa  40.8  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  29.71 
 
 		 194 aa  40.8  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>