More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2725 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 92 aa  169  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  96.2 
 
 		 91 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  96.2 
 
 		 91 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2717  30S ribosomal protein S20  75.95 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  50.63 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  51.25 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  53.09 
 
 		 87 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  50.63 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  48.86 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 87 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  46.25 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  51.22 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2678  30S ribosomal protein S20  44.94 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.855392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0390  30S ribosomal protein S20  56.25 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  43.9 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  47.37 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  46.05 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 86 aa  63.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5323  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.761405  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4421  30S ribosomal protein S20  46.25 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  46.25 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0001  30S ribosomal protein S20  51.85 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000869567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1517  SSU ribosomal protein S20P  44.74 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.256049  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  46.25 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4712  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822452  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4039  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 92 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2556  30S ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 92 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 92 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 92 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 92 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 92 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0016  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  40.24 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4102  SSU ribosomal protein S20P  49.38 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  43.04 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>