More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0116 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
149 aa  290  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  97.99 
 
 
149 aa  254  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  97.99 
 
 
149 aa  254  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  86.49 
 
 
149 aa  213  6e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  48.98 
 
 
171 aa  150  6e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  2.25617e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  49.66 
 
 
148 aa  148  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  50.68 
 
 
147 aa  147  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  51.01 
 
 
168 aa  146  1e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  45.83 
 
 
149 aa  144  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 
167 aa  143  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  47.22 
 
 
147 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  47.22 
 
 
160 aa  140  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  48.61 
 
 
148 aa  139  1e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  46.94 
 
 
167 aa  139  2e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  47.92 
 
 
148 aa  138  2e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.45753e-06  hitchhiker  1.02152e-13 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  48.65 
 
 
151 aa  138  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.25439e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  46.53 
 
 
147 aa  137  4e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  47.26 
 
 
148 aa  137  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  45.83 
 
 
147 aa  137  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  46.98 
 
 
153 aa  137  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  45.27 
 
 
159 aa  136  8e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  46.21 
 
 
149 aa  136  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  45.95 
 
 
148 aa  134  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  3.17895e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
148 aa  131  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  7.23092e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  48.3 
 
 
147 aa  131  4e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  44.59 
 
 
151 aa  130  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.57053e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 
151 aa  127  7e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  7.81135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  49.66 
 
 
146 aa  126  9e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  46.31 
 
 
151 aa  126  9e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  49.31 
 
 
168 aa  125  1e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
151 aa  124  4e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
148 aa  124  5e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  3.15624e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  47.33 
 
 
149 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0654  50S ribosomal protein L9  48.32 
 
 
150 aa  120  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  41.38 
 
 
148 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  42.95 
 
 
147 aa  120  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  42.57 
 
 
149 aa  120  9e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 
148 aa  119  1e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
148 aa  119  1e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  46.53 
 
 
202 aa  119  2e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  45.52 
 
 
148 aa  119  2e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  45.83 
 
 
189 aa  119  2e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2002  50S ribosomal protein L9  47.97 
 
 
153 aa  119  2e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148705  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  45.83 
 
 
189 aa  118  2e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 
148 aa  119  2e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  41.22 
 
 
149 aa  119  2e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  44.08 
 
 
188 aa  118  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 
149 aa  117  4e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  42.36 
 
 
147 aa  117  5e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.98897e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 
209 aa  117  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  45.27 
 
 
168 aa  117  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  46.53 
 
 
194 aa  117  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 
190 aa  116  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 
190 aa  116  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  42.57 
 
 
151 aa  116  9e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 
190 aa  116  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  42.18 
 
 
147 aa  116  1e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  41.89 
 
 
151 aa  115  1e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  46.62 
 
 
149 aa  115  2e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  6.51865e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
149 aa  115  2e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  43.06 
 
 
147 aa  115  2e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  42.86 
 
 
149 aa  115  2e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  44.74 
 
 
189 aa  115  2e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  46.26 
 
 
148 aa  115  2e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  44.22 
 
 
148 aa  114  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 
148 aa  115  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  40.94 
 
 
149 aa  114  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  43.75 
 
 
189 aa  114  4e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
165 aa  114  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
151 aa  114  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  5.08651e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  42.28 
 
 
193 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  43.45 
 
 
148 aa  114  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 
149 aa  113  8e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  46.62 
 
 
150 aa  112  1e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  43.75 
 
 
189 aa  112  1e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 
189 aa  113  1e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2587  50S ribosomal protein L9  44.12 
 
 
150 aa  112  2e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  45.58 
 
 
148 aa  112  2e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 
149 aa  111  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 
190 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 
195 aa  111  4e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
147 aa  110  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2131  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 
149 aa  110  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.103333  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2050  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 
149 aa  110  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3991  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
165 aa  110  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00054476 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
148 aa  110  7e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.08464e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  40.28 
 
 
179 aa  110  7e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  43.75 
 
 
189 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  43.75 
 
 
189 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 
204 aa  110  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  39.73 
 
 
148 aa  109  1e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  39.19 
 
 
148 aa  108  2e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 
152 aa  108  2e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
191 aa  108  2e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  43.07 
 
 
148 aa  108  2e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  42.57 
 
 
148 aa  108  2e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  45.11 
 
 
189 aa  108  2e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 
152 aa  108  2e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 
209 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 
149 aa  107  4e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.31124e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>