More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4583 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4583  nucleotidyl transferase  100 
 
 
263 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.693762  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3958  nucleotidyl transferase  75.97 
 
 
271 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3308  nucleotidyl transferase  75.97 
 
 
271 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0194  nucleotidyl transferase  72.13 
 
 
247 aa  332  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0983981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0937  nucleotidyl transferase  65.65 
 
 
272 aa  302  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0085  nucleotidyl transferase  62.88 
 
 
272 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420165  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5261  Nucleotidyl transferase  65.83 
 
 
236 aa  298  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  63.41 
 
 
245 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4828  nucleotidyl transferase  58.02 
 
 
232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0257  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  55.14 
 
 
234 aa  226  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  51.84 
 
 
237 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0218  nucleotidyl transferase  45.77 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0125725 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1576  Nucleotidyl transferase  45.6 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1872  nucleotidyl transferase  45.1 
 
 
236 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  50 
 
 
243 aa  175  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  43.1 
 
 
220 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  45.04 
 
 
232 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  44.49 
 
 
226 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  45.04 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  49.38 
 
 
240 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  49.79 
 
 
223 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  48.16 
 
 
232 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  46.59 
 
 
223 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  48.97 
 
 
223 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0673  Nucleotidyl transferase  44.53 
 
 
242 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  44.72 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  42.68 
 
 
232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  48.95 
 
 
223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  43.85 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  43.55 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  48.55 
 
 
223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  46.75 
 
 
228 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  44.72 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  43.9 
 
 
225 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  44.72 
 
 
225 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  44.58 
 
 
226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  45.97 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  45.97 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  47.52 
 
 
223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  44.31 
 
 
225 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  45.53 
 
 
222 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  44.9 
 
 
221 aa  162  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0511  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  47.11 
 
 
241 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.560778  normal  0.0591515 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0690  nucleotidyl transferase family protein  46.59 
 
 
239 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0493  nucleotidyl transferase  43.53 
 
 
245 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  46.86 
 
 
223 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0402  Nucleotidyl transferase  44.58 
 
 
234 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  43.36 
 
 
241 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2739  nucleotidyltransferase family protein  46.18 
 
 
239 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0206  nucleotidyltransferase family protein  46.18 
 
 
239 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0868  nucleotidyltransferase family protein  46.18 
 
 
239 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2339  nucleotidyltransferase family protein  46.18 
 
 
239 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329535  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  47.52 
 
 
230 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  45.78 
 
 
239 aa  158  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  48.76 
 
 
222 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  44.31 
 
 
236 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0704  nucleotidyl transferase family protein  45.78 
 
 
239 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2419  nucleotidyltransferase family protein  45.97 
 
 
231 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  42.39 
 
 
229 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  45.38 
 
 
240 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  44.31 
 
 
222 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  47.39 
 
 
224 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  46.69 
 
 
221 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0433  nucleotidyl transferase  43.14 
 
 
232 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73488  normal  0.148714 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  45.12 
 
 
222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2765  nucleotidyl transferase  43.95 
 
 
239 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  43.78 
 
 
240 aa  155  9e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2631  nucleotidyl transferase  43.92 
 
 
239 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311513  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  44.98 
 
 
240 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0387  Nucleotidyl transferase  44.35 
 
 
230 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  44.35 
 
 
240 aa  155  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  44.98 
 
 
240 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  45.27 
 
 
228 aa  154  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0556  nucleotidyltransferase family protein  47.84 
 
 
210 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  43.03 
 
 
249 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  42.39 
 
 
222 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  43.78 
 
 
240 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  43.25 
 
 
232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  46.99 
 
 
224 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  44.31 
 
 
236 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  45.27 
 
 
223 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0573  nucleotidyltransferase family protein  44.18 
 
 
239 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  48.97 
 
 
222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  42.08 
 
 
232 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  42.19 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  35.8 
 
 
251 aa  137  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  37.35 
 
 
219 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.35 
 
 
219 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  39.18 
 
 
242 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  38 
 
 
246 aa  132  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2431  nucleotidyl transferase  43.32 
 
 
223 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  38.96 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  36.33 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  36.33 
 
 
220 aa  125  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  36.44 
 
 
253 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  33.47 
 
 
239 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  34.54 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  34.26 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  35.77 
 
 
252 aa  92.8  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  32.4 
 
 
243 aa  92.8  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>