234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2434 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  407  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  75.38 
 
 
218 aa  300  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  75.52 
 
 
200 aa  298  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  74.36 
 
 
222 aa  295  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  73.96 
 
 
197 aa  290  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  73.47 
 
 
196 aa  259  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  70.62 
 
 
197 aa  257  9e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  67.89 
 
 
212 aa  250  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  63.73 
 
 
199 aa  247  9e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3648  hypothetical protein  70.1 
 
 
197 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.987474  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  53.89 
 
 
195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  54.12 
 
 
195 aa  193  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  53.37 
 
 
195 aa  193  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  54.92 
 
 
195 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  53.89 
 
 
195 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  54.92 
 
 
195 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  54.92 
 
 
195 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  54.74 
 
 
194 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  54.36 
 
 
195 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  52.68 
 
 
245 aa  191  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  54.4 
 
 
194 aa  190  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  54.21 
 
 
194 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  54.21 
 
 
239 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  51.49 
 
 
204 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  53.57 
 
 
213 aa  185  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  53.48 
 
 
290 aa  177  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  54.12 
 
 
196 aa  174  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  54.12 
 
 
196 aa  174  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  54.12 
 
 
303 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  54.12 
 
 
303 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  54.12 
 
 
303 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  54.12 
 
 
303 aa  167  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  35.45 
 
 
212 aa  135  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  40 
 
 
219 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  41.49 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  38.15 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  39.46 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  37.31 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  35.6 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  38.92 
 
 
203 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  38.92 
 
 
203 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  38.92 
 
 
203 aa  123  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  38.95 
 
 
201 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  38.89 
 
 
209 aa  122  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  39.89 
 
 
204 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  34.38 
 
 
213 aa  121  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  44.06 
 
 
215 aa  121  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  40.31 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  35.98 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  33.16 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  33.16 
 
 
211 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  37.44 
 
 
198 aa  119  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.16 
 
 
211 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.16 
 
 
211 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  34.21 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  33.16 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  33.16 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  32.63 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  36.88 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  34.38 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  35.33 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  38.42 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  32.63 
 
 
211 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  43.41 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  32.63 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  38.73 
 
 
212 aa  114  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  33.71 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  34.9 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  38.95 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  38.42 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  37.5 
 
 
211 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  46.03 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  40.33 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  37.31 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  39.89 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  27.66 
 
 
197 aa  109  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  39.66 
 
 
201 aa  109  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  36.17 
 
 
198 aa  109  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  40 
 
 
210 aa  109  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  37.22 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  34.74 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  36.32 
 
 
196 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  40.64 
 
 
274 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  35.46 
 
 
195 aa  108  7.000000000000001e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  39.01 
 
 
203 aa  107  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  32.63 
 
 
197 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  34.21 
 
 
197 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  38.17 
 
 
201 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  33.51 
 
 
198 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  36.84 
 
 
212 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  45.16 
 
 
242 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  39.31 
 
 
210 aa  105  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  34.21 
 
 
194 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  34.27 
 
 
219 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  36 
 
 
204 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  33.17 
 
 
207 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  32.63 
 
 
193 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  40 
 
 
203 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  32.09 
 
 
221 aa  102  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  38.79 
 
 
205 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>