115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0077 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_R0077  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tPseudo01  tRNA-OTHER  92.31 
 
 		 89 bp  71.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0002  tRNA-Tyr  97.37 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0012  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000365391  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0560  tRNA-Tyr  90.16 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000480165  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0060  tRNA-Tyr  91.23 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0059  tRNA-Tyr  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000803667  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0077  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000407125  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0014  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000673515  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0017  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0316061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0086  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000985673  normal  0.992402 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0006  tRNA-Tyr  84.71 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000157538  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0054  tRNA-Tyr  90.57 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0021  tRNA-Tyr  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.359257  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0007  tRNA-Tyr  90.57 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.737709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0056  tRNA-Tyr  90.57 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467889  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0058  tRNA-Tyr  90.57 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t05  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 81 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000929423  unclonable  0.000000191468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0048  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14005  tRNA-Tyr  91.49 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.844659 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0020  tRNA-Tyr  85.06 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0019  tRNA-Tyr  94.29 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00432304  decreased coverage  0.00738157 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0109  tRNA-Tyr  90.7 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0037  tRNA-Tyr  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.216376  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0017  tRNA-Tyr  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0063  tRNA-Tyr  89.13 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0010  tRNA-Tyr  87.93 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0013  tRNA-Tyr  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469327  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0043  tRNA-Tyr  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000118909  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0024  tRNA-Tyr  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000291994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0012  tRNA-Tyr  89.13 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000201631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0038  tRNA-Tyr  89.13 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000481051  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0013  tRNA-Tyr  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000223303  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0027  tRNA-Tyr  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.645758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0008  tRNA-Tyr  91.11 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323474  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0068  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00106012  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t05  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.347448  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt04  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt04  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA69  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00000487503  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0010  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  7.29414e-23  normal  0.0775658 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0044  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000011625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0014  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.64782e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0018  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0023  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000432297  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0015  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0069  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0031  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.219663 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0013  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000521392  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0004  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000291052  hitchhiker  0.00000658966 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0045  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011189  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0308  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.0000522223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0022  tRNA-Tyr  84.72 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0256241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0037  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0466069  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt06  tRNA-Tyr  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt10  tRNA-Tyr  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.882625 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5651  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000725819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5679  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000538647  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0050  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000316602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000395282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00144807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000630573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000017627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0044  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0075  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0051  tRNA-Tyr  87.27 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0044  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0075  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0037  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000436078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0082  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000708983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0094  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000196241  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0046  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0010  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0037  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0086  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00209074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0098  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0020  tRNA-Tyr  84.51 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0051  tRNA-Tyr  84.51 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0589159  unclonable  6.439e-24 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0022  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0158353  normal  0.287055 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0047  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460212  normal  0.496186 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0192  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000718643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0608  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0854  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000540408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5654  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000770795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5714  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5726  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000809965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4577  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000592849  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4769  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000283777  hitchhiker  6.00721e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5144  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000379395  normal  0.810906 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0171  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0235528 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0533  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.30142e-31 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>