84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_R0046 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_R0046  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0100  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0037  tRNA-Tyr  98.82 
 
 		 85 bp  161  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.216376  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0109  tRNA-Tyr  98.78 
 
 		 82 bp  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0037  tRNA-Tyr  95.29 
 
 		 84 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0086  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00209074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4769  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000283777  hitchhiker  6.00721e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4577  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000592849  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5726  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000809965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5714  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5654  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000770795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0854  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000540408  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0608  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0192  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000718643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0098  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0533  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.30142e-31 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0094  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000196241  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0082  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000708983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0037  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000436078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0075  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0075  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 87 bp  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000395282  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5651  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000725819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5679  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000538647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5688  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000511712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 87 bp  121  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 87 bp  121  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000316602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 87 bp  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 87 bp  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5144  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000379395  normal  0.810906 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 87 bp  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 87 bp  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00144807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 87 bp  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000630573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000017627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0779  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.74653e-30 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0171  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0235528 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0044  tRNA-Tyr  93.9 
 
 		 81 bp  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0044  tRNA-Tyr  95.71 
 
 		 82 bp  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0090  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 81 bp  99.6  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2567  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 81 bp  99.6  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0637  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 81 bp  87.7  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000210414  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 81 bp  87.7  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000135792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 81 bp  87.7  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.875932  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 81 bp  87.7  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1595  tRNA-Tyr  90.62 
 
 		 82 bp  79.8  0.00000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957281  normal  0.565179 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1539  tRNA-Tyr  90.62 
 
 		 82 bp  79.8  0.00000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0405  tRNA-Tyr  87.06 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1846  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt013  tRNA-Tyr  84.71 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0080367  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0039  tRNA-Tyr  96.97 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  hitchhiker  0.000000304321 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0013  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000305155  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0015  tRNA-Tyr  86.3 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000359756  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0014  tRNA-Tyr  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000194257  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna128  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000522671  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna049  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000729989  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna126  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna127  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000596133  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0011  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2720  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000267596  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0437  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000091753  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R25  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0436  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0062  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.101175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0434  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168072  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0435  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000139864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0047  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460212  normal  0.496186 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0072  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0003  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0010  tRNA-Tyr  96.43 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000653583  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0235  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00420239  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1925  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00221935  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0006  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000210232  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0045  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00129777  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0077  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01443  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01442  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01441  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01440  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00236  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3168t  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3207t  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0563071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>