12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_R0017 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_R0017  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0077  tRNA-Tyr  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0060  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0034  tRNA-Tyr  85.71 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0365863  normal  0.384153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0002  tRNA-Tyr  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0048  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t05  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000929423  unclonable  0.000000191468 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0014  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0213488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tPseudo01  tRNA-OTHER  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0014  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000673515  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0017  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0316061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0086  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000985673  normal  0.992402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>