More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0405 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 311 aa  637    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 311 aa  637    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  60.47 
 
 		 302 aa  395  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  64 
 
 		 300 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  63.55 
 
 		 306 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  62.88 
 
 		 306 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  63.61 
 
 		 304 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  63.67 
 
 		 303 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  65.99 
 
 		 300 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  61.87 
 
 		 307 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  63.67 
 
 		 301 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  59.33 
 
 		 306 aa  381  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  61.79 
 
 		 305 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  61.67 
 
 		 305 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  62.21 
 
 		 306 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  61.87 
 
 		 306 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  62.33 
 
 		 298 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  61.87 
 
 		 306 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  61.33 
 
 		 305 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  61.54 
 
 		 306 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  61.54 
 
 		 306 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 		 307 aa  371  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  62.17 
 
 		 304 aa  371  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  59.2 
 
 		 309 aa  364  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  60 
 
 		 304 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  59.06 
 
 		 309 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  58.86 
 
 		 309 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  58.67 
 
 		 308 aa  363  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  59.87 
 
 		 303 aa  361  8e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  56 
 
 		 305 aa  361  9e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  58.19 
 
 		 307 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  57.67 
 
 		 309 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  57.53 
 
 		 309 aa  358  5e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  57.53 
 
 		 309 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  57.53 
 
 		 309 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  57.53 
 
 		 309 aa  358  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  57.53 
 
 		 309 aa  358  5e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  57.53 
 
 		 309 aa  358  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  57.53 
 
 		 309 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  57.67 
 
 		 309 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  57.67 
 
 		 309 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  57.53 
 
 		 309 aa  358  7e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  57.67 
 
 		 309 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  57.43 
 
 		 329 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  57.19 
 
 		 329 aa  355  6.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  57 
 
 		 309 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  56.33 
 
 		 326 aa  353  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  57 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  56.86 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  56.33 
 
 		 326 aa  351  7e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  56.33 
 
 		 311 aa  351  8e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  58.47 
 
 		 305 aa  351  8e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 		 560 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  59.33 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2902  ornithine carbamoyltransferase  57.53 
 
 		 307 aa  348  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  0.667761 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  55.3 
 
 		 305 aa  348  8e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  55.3 
 
 		 305 aa  348  8e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  55.63 
 
 		 306 aa  345  4e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  54.97 
 
 		 310 aa  345  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  55.81 
 
 		 309 aa  345  7e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  56.15 
 
 		 302 aa  344  8e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  55.18 
 
 		 308 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  55.18 
 
 		 308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  55.18 
 
 		 308 aa  342  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  54 
 
 		 306 aa  342  4e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  56.27 
 
 		 320 aa  341  8e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  55.31 
 
 		 320 aa  341  9e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  55.33 
 
 		 308 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  55.33 
 
 		 306 aa  334  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  54.64 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  54.97 
 
 		 316 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  52.63 
 
 		 315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 		 319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  54.75 
 
 		 321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  54.61 
 
 		 309 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  53 
 
 		 312 aa  322  7e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  56.67 
 
 		 308 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  52.96 
 
 		 309 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  53.18 
 
 		 302 aa  318  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  52.82 
 
 		 312 aa  318  7.999999999999999e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  52.82 
 
 		 312 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  52.49 
 
 		 312 aa  317  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 		 303 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  51.97 
 
 		 313 aa  316  4e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 		 303 aa  315  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 305 aa  315  6e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  53.47 
 
 		 314 aa  315  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 		 308 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  52.92 
 
 		 311 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 		 310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  51.99 
 
 		 303 aa  312  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  52.82 
 
 		 302 aa  312  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  52.49 
 
 		 305 aa  311  7.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  52.63 
 
 		 312 aa  311  7.999999999999999e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  51.5 
 
 		 303 aa  311  9e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  52.82 
 
 		 317 aa  311  9e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  52.94 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>