43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0127 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  98.41 
 
 		 566 aa  1150    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  73.87 
 
 		 577 aa  847    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  96.63 
 
 		 571 aa  1100    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  100 
 
 		 566 aa  1162    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  30.47 
 
 		 658 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  26.94 
 
 		 670 aa  232  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  28.95 
 
 		 662 aa  231  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  29.69 
 
 		 615 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  30.14 
 
 		 757 aa  217  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  28.54 
 
 		 689 aa  217  5.9999999999999996e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  28.12 
 
 		 619 aa  207  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  30.15 
 
 		 616 aa  207  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  26.93 
 
 		 688 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  29.98 
 
 		 616 aa  206  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  27.27 
 
 		 618 aa  203  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  28.93 
 
 		 618 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  27.11 
 
 		 688 aa  194  3e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3925  hypothetical protein  43.75 
 
 		 236 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  29.23 
 
 		 655 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  28.72 
 
 		 729 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1877  deca-heme C-type cytochrome-like protein  38.18 
 
 		 241 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2001  deca-heme C-type cytochrome-like  38.18 
 
 		 241 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1962  deca-heme C-type cytochrome-like protein  38.18 
 
 		 241 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.282752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1806  deca-heme C-type cytochrome-like protein  35 
 
 		 247 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  28.57 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  28.57 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  27.46 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  26.27 
 
 		 211 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  32.1 
 
 		 270 aa  57  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  27.05 
 
 		 489 aa  57  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  25.17 
 
 		 461 aa  52  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  31.01 
 
 		 270 aa  47.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2381  hypothetical protein  26.82 
 
 		 270 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  22.74 
 
 		 473 aa  46.6  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  27.78 
 
 		 206 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  26.25 
 
 		 337 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  25.93 
 
 		 471 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  25 
 
 		 206 aa  44.3  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  23.87 
 
 		 407 aa  43.9  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0797  formate dehydrogenase gamma subunit  25.21 
 
 		 229 aa  43.9  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205396  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  28.49 
 
 		 266 aa  43.9  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  30.06 
 
 		 266 aa  43.5  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>