308 genes were found for organism Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Xaut_4789  CDS  NC_009717  540  1703  +  1164  cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001409242  normal  0.076168  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4790  CDS  NC_009717  1700  2707  +  1008  parB-like partition protein  YP_001409243  normal  0.636081  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4791  CDS  NC_009717  2888  4159  +  1272  replication initiation protein RepC  YP_001409244  normal  0.0348646  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4792  CDS  NC_009717  4222  5313  -  1092  integrase family protein  YP_001409245  decreased coverage  0.00356022  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4793  CDS  NC_009717  5313  5723  -  411  PilT domain-containing protein  YP_001409246  hitchhiker  0.0079864  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4794  CDS  NC_009717  5711  6496  -  786  hypothetical protein  YP_001409247  normal  0.0389346  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4795    NC_009717  6580  7389  +  810      normal  0.254161  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4796  CDS  NC_009717  7705  8637  -  933  resolvase domain-containing protein  YP_001409248  normal  0.271999  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4797  CDS  NC_009717  8873  9259  -  387  PilT domain-containing protein  YP_001409249  normal  0.165987  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4798  CDS  NC_009717  9259  9516  -  258  transcription factor  YP_001409250  normal  0.0788707  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4799  CDS  NC_009717  9688  10638  +  951  hypothetical protein  YP_001409251  normal  0.181071  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4800  CDS  NC_009717  10641  11366  +  726  putative transcriptional regulator  YP_001409252  normal  0.172274  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4801  CDS  NC_009717  11363  12748  +  1386  hypothetical protein  YP_001409253  normal  0.463426  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4802  CDS  NC_009717  12880  13194  -  315  hypothetical protein  YP_001409254  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4803  CDS  NC_009717  13919  14905  +  987  ATPase central domain-containing protein  YP_001409255  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4804  CDS  NC_009717  14906  17401  +  2496  hypothetical protein  YP_001409256  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4805  CDS  NC_009717  18054  18311  -  258  hypothetical protein  YP_001409257  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4806  CDS  NC_009717  18428  19060  -  633  hypothetical protein  YP_001409258  normal  1  normal  0.826039  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4807  CDS  NC_009717  19170  20729  +  1560  recombinase  YP_001409259  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4808  CDS  NC_009717  20729  21649  +  921  nuclease  YP_001409260  normal  1  normal  0.46194  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4809  CDS  NC_009717  21646  22539  +  894  RepB plasmid partition  YP_001409261  normal  1  normal  0.32089  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4810    NC_009717  22690  23082  -  393      normal  1  normal  0.566533  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4811  CDS  NC_009717  23290  23775  -  486  hypothetical protein  YP_001409262  normal  1  normal  0.405374  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4812    NC_009717  24185  24556  +  372      normal  1  normal  0.397582  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4813  CDS  NC_009717  24605  24835  -  231  hypothetical protein  YP_001409263  normal  1  normal  0.394835  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4814    NC_009717  24919  25221  -  303      normal  1  normal  0.402475  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4815  CDS  NC_009717  25591  25998  +  408  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001409264  normal  1  normal  0.290342  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4816  CDS  NC_009717  25995  26342  +  348  IS66 Orf2 family protein  YP_001409265  normal  1  normal  0.191561  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4817  CDS  NC_009717  26439  28040  +  1602  transposase IS66  YP_001409266  normal  1  normal  0.171914  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4818  CDS  NC_009717  28162  28710  -  549  hypothetical protein  YP_001409267  normal  1  normal  0.192973  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4819  CDS  NC_009717  28807  29154  -  348  IS66 Orf2 family protein  YP_001409268  normal  1  normal  0.115753  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4820  CDS  NC_009717  29151  29657  -  507  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001409269  normal  1  normal  0.187465  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4821  CDS  NC_009717  29682  30038  +  357  transposase  YP_001409270  normal  1  normal  0.188807  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4822    NC_009717  30058  30213  +  156      normal  1  normal  0.184844  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4823  CDS  NC_009717  30429  30713  -  285  hypothetical protein  YP_001409271  normal  1  normal  0.186817  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4824  CDS  NC_009717  30735  31217  -  483  blue (type1) copper domain-containing protein  YP_001409272  normal  0.904248  normal  0.294152  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4825  CDS  NC_009717  31251  32654  -  1404  multicopper oxidase type 3  YP_001409273  normal  1  normal  0.355944  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4826  CDS  NC_009717  32672  34099  -  1428  outer membrane efflux protein  YP_001409274  normal  0.836634  normal  0.338795  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4827  CDS  NC_009717  35415  36731  +  1317  hypothetical protein  YP_001409275  normal  0.202847  normal  0.0862783  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4828  CDS  NC_009717  37507  38196  -  690  cyclic nucleotide-binding protein  YP_001409276  normal  1  normal  0.0724019  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4829  CDS  NC_009717  38390  38749  -  360  hypothetical protein  YP_001409277  normal  1  normal  0.0645856  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4830  CDS  NC_009717  38913  39470  -  558  hypothetical protein  YP_001409278  normal  0.938027  normal  0.116697  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4831  CDS  NC_009717  39519  39926  +  408  hypothetical protein  YP_001409279  normal  0.790573  normal  0.0686634  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4832  CDS  NC_009717  39923  41341  +  1419  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_001409280  normal  1  normal  0.0873289  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4833  CDS  NC_009717  41338  44508  +  3171  CzcA family heavy metal efflux protein  YP_001409281  normal  1  normal  0.0831528  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4834  CDS  NC_009717  45349  47739  -  2391  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_001409282  normal  0.311359  normal  0.100077  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4835  CDS  NC_009717  47732  48406  -  675  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  YP_001409283  normal  0.0530651  normal  0.102652  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4836  CDS  NC_009717  48403  48696  -  294  hypothetical protein  YP_001409284  hitchhiker  0.00815326  normal  0.0901781  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4837  CDS  NC_009717  48765  49457  -  693  hypothetical protein  YP_001409285  hitchhiker  0.00868902  normal  0.100202  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4838  CDS  NC_009717  49511  51436  -  1926  hypothetical protein  YP_001409286  normal  0.154027  normal  0.12668  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4839  CDS  NC_009717  51498  51890  -  393  hypothetical protein  YP_001409287  normal  0.681102  normal  0.324651  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4840  CDS  NC_009717  52463  53956  -  1494  multicopper oxidase type 2  YP_001409288  normal  1  normal  0.418556  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4841  CDS  NC_009717  54058  54855  -  798  hypothetical protein  YP_001409289  normal  1  normal  0.160806  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4842  CDS  NC_009717  54976  55371  -  396  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001409290  normal  0.926413  normal  0.140801  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4843  CDS  NC_009717  55473  56807  -  1335  transposase IS4 family protein  YP_001409291  normal  1  normal  0.0683585  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4844  CDS  NC_009717  56937  58064  -  1128  ABC-2 type transporter  YP_001409292  normal  1  normal  0.0699099  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4845  CDS  NC_009717  58067  60853  -  2787  ABC transporter related  YP_001409293  normal  0.771087  normal  0.268191  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4846  CDS  NC_009717  60843  61841  -  999  secretion protein HlyD family protein  YP_001409294  normal  1  normal  0.173931  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4847  CDS  NC_009717  62437  64893  +  2457  copper-translocating P-type ATPase  YP_001409295  normal  1  normal  0.24461  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4848  CDS  NC_009717  64932  66152  +  1221  major facilitator transporter  YP_001409296  normal  0.869631  normal  0.114324  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4849  CDS  NC_009717  66347  67165  +  819  hypothetical protein  YP_001409297  normal  1  normal  0.0355335  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4850    NC_009717  67344  67712  -  369      normal  1  normal  0.0492433  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4851  CDS  NC_009717  68098  68298  +  201  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001409298  normal  1  normal  0.0283322  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4852  CDS  NC_009717  68417  69199  +  783  integrase catalytic region  YP_001409299  normal  1  normal  0.0318827  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4853  CDS  NC_009717  69460  70827  -  1368  hypothetical protein  YP_001409300  normal  1  normal  0.0374369  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4854  CDS  NC_009717  70833  71915  -  1083  hypothetical protein  YP_001409301  normal  1  normal  0.0102766  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4855  CDS  NC_009717  71915  72220  -  306  hypothetical protein  YP_001409302  normal  0.499581  normal  0.0160567  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4856  CDS  NC_009717  72820  73113  -  294  hypothetical protein  YP_001409303  normal  0.274271  normal  0.0158859  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4857  CDS  NC_009717  73766  75259  +  1494  methane/phenol/toluene hydroxylase  YP_001409304  normal  0.082665  normal  0.0406532  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4858  CDS  NC_009717  75296  75562  +  267  toluene-4-monooxygenase system B  YP_001409305  normal  0.0682005  normal  0.0304131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4859  CDS  NC_009717  75559  75927  +  369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  YP_001409306  normal  0.0807982  normal  0.0317192  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4860  CDS  NC_009717  75930  76235  +  306  monooxygenase component MmoB/DmpM  YP_001409307  normal  0.111656  normal  0.0554235  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4861  CDS  NC_009717  76267  77292  +  1026  methane/phenol/toluene hydroxylase  YP_001409308  normal  0.275341  normal  0.071764  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4862  CDS  NC_009717  77267  78331  +  1065  oxidoreductase FAD-binding subunit  YP_001409309  normal  0.350242  normal  0.072998  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4863  CDS  NC_009717  78361  79524  +  1164  aldehyde dehydrogenase  YP_001409310  normal  0.161146  normal  0.113371  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4864  CDS  NC_009717  79821  80645  -  825  DNA binding domain-containing protein  YP_001409311  normal  0.68065  normal  0.158916  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4865  CDS  NC_009717  81145  82275  +  1131  2-hydroxypropyl-CoM lyase  YP_001409312  normal  1  normal  0.0677813  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4866  CDS  NC_009717  82344  82544  +  201  hypothetical protein  YP_001409313  normal  1  normal  0.0539938  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4867  CDS  NC_009717  82602  84173  +  1572  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  YP_001409314  normal  1  normal  0.0742822  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4868  CDS  NC_009717  84170  84922  +  753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001409315  normal  0.758731  normal  0.103076  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4869  CDS  NC_009717  84969  85718  +  750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001409316  normal  0.506283  normal  0.100596  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4870    NC_009717  85861  86792  +  932      normal  0.129039  normal  0.0360357  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4872  CDS  NC_009717  86782  87687  +  906  phosphosulfolactate synthase  YP_001409317  normal  0.0301942  normal  0.106231  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4873  CDS  NC_009717  87680  89197  +  1518  argininosuccinate lyase  YP_001409318  normal  0.229166  normal  0.0775388  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4874  CDS  NC_009717  89194  90564  +  1371  fumarate lyase  YP_001409319  normal  0.0760075  normal  0.0695852  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4875  CDS  NC_009717  90551  91546  +  996  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  YP_001409320  normal  0.338198  normal  0.0605398  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4876  CDS  NC_009717  91533  92540  +  1008  LysR family transcriptional regulator  YP_001409321  normal  1  normal  0.0982311  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4877  CDS  NC_009717  92674  93429  -  756  OmpW family protein  YP_001409322  normal  0.913281  normal  0.338294  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4878  CDS  NC_009717  93480  94835  +  1356  transposase IS4 family protein  YP_001409323  normal  0.889581  normal  0.178611  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4879    NC_009717  94832  95059  +  228      normal  1  normal  0.141377  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4880  CDS  NC_009717  95125  96633  +  1509  Bilirubin oxidase  YP_001409324  normal  1  normal  0.297239  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4881  CDS  NC_009717  96904  97290  +  387  hypothetical protein  YP_001409325  normal  1  normal  0.489198  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4882  CDS  NC_009717  97283  97858  +  576  rhodanese domain-containing protein  YP_001409326  normal  1  normal  0.70517  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4883  CDS  NC_009717  97900  98262  +  363  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 3  YP_001409327  normal  1  normal  0.635866  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4884  CDS  NC_009717  98259  98591  +  333  Ni Fe-hydrogenase III large subunit-like protein  YP_001409328  normal  1  normal  0.65267  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4885  CDS  NC_009717  98595  99212  -  618  hypothetical protein  YP_001409329  normal  1  normal  0.935392  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4886  CDS  NC_009717  99605  99877  +  273  hypothetical protein  YP_001409330  normal  1  normal  0.894999  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4887  CDS  NC_009717  99906  100568  +  663  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  YP_001409331  normal  1  normal  0.724269  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4888  CDS  NC_009717  100845  101165  +  321  hypothetical protein  YP_001409332  normal  0.503138  normal  0.689634  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_4889  CDS  NC_009717  101921  102622  +  702  autoinducer-binding domain-containing protein  YP_001409333  normal  0.70592  normal  0.843155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>