157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4828 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4828  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 229 aa  464  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0724019 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4595  CRP/FNR family transcriptional regulator  96.07 
 
 		 229 aa  447  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596625  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6767  cyclic nucleotide-binding protein  27.47 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171014  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6568  cyclic nucleotide-binding protein  27.47 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538415  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3304  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.72 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.51 
 
 		 258 aa  62  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  28.16 
 
 		 225 aa  62  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3301  cyclic nucleotide-binding protein  25.73 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00259627 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  24.87 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2635  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4140  cyclic nucleotide-binding protein  30.27 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4711  cyclic nucleotide-binding protein  28 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  decreased coverage  0.00295307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5739  cyclic nucleotide-binding protein  25.54 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172184 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2874  cyclic nucleotide-binding protein  26.29 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.191735 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.34 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0519  Fnr-like transcriptional activator  24.7 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  25.43 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.28 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.71 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.67 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.82 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.86 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.14 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4566  cyclic nucleotide-binding protein  26.26 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.97 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1844  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1896  cyclic nucleotide-binding protein  24 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2685  cAMP-binding protein  26.38 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4881  putative cyclic-AMP receptor-like protein  27.09 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4195  cyclic nucleotide-binding  26.26 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.164725  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.28 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0629  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.73 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  22.22 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.12 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 222 aa  51.6  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3673  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.55 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2963  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.35 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  24.05 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.13 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1610  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.503286  normal  0.0459235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3348  cyclic nucleotide-binding  27.55 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.41 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.56 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5695  cyclic nucleotide-binding protein  28.9 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0746044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0229  cyclic nucleotide-binding protein  27.91 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0740  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.194826  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3149  cyclic nucleotide-binding protein  23.59 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.62 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4187  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.81 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  28.97 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.71 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.66 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.9 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.6 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3398  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.25 
 
 		 252 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0291  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1975  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1275  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.6 
 
 		 239 aa  48.5  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6152  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2139  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.93 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3735  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.43 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.11 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1619  cyclic nucleotide-binding  26.92 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  25.99 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.33 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.14 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.93 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  27.59 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.71 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1045  Crp-like transcriptional regulator  22.4 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6158  cyclic nucleotide-binding protein  28.25 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2535  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0880  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.86 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.812688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.02 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.93 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0528  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.28 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>