28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4886 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4886  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  181  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.894999 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3869  hypothetical protein  56.76 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5296  hypothetical protein  57.38 
 
 
83 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468297  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1656  hypothetical protein  57.38 
 
 
83 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000173023  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2714  hypothetical protein  52 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000197127  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1465  hypothetical protein  51.72 
 
 
94 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5390  hypothetical protein  50.62 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0426586 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2194  hypothetical protein  53.7 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4518  hypothetical protein  48.84 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.292766  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6005  hypothetical protein  56.52 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850513  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0420  hypothetical protein  48.84 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0025  hypothetical protein  49.38 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.699949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0027  hypothetical protein  49.38 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882898  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0026  hypothetical protein  49.38 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834973  hitchhiker  0.00036673 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2342  hypothetical protein  44.94 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114019  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4143  hypothetical protein  38.81 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.256309 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1175  hypothetical protein  53.33 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3971  hypothetical protein  60.98 
 
 
84 aa  53.9  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2276  hypothetical protein  60.78 
 
 
86 aa  53.9  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0447  hypothetical protein  49.02 
 
 
90 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821045  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2711  hypothetical protein  44.26 
 
 
86 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0128367  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2230  hypothetical protein  36.05 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535182  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1383  hypothetical protein  43.75 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1936  hypothetical protein  48.78 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578863  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0073  hypothetical protein  51.85 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.49801 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1468  hypothetical protein  45.45 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1644  hypothetical protein  37.29 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.129371 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1491  hypothetical protein  46.38 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>