30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2711 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2711  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  177  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0128367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1468  hypothetical protein  81.18 
 
 		 82 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1644  hypothetical protein  59.74 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2230  hypothetical protein  55.93 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0447  hypothetical protein  49.15 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2342  hypothetical protein  52 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1175  hypothetical protein  49.15 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5390  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0426586 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1465  hypothetical protein  44.83 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0026  hypothetical protein  47.54 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834973  hitchhiker  0.00036673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0025  hypothetical protein  47.54 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.699949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0027  hypothetical protein  47.54 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0420  hypothetical protein  44.26 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3869  hypothetical protein  39.24 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3974  hypothetical protein  59.57 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.891922  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4518  hypothetical protein  40.68 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.292766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2714  hypothetical protein  45.83 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000197127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2194  hypothetical protein  43.75 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0265  hypothetical protein  84 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3419  hypothetical protein  84 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4143  hypothetical protein  36.36 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.256309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2276  hypothetical protein  62.86 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3971  hypothetical protein  58.97 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6005  hypothetical protein  43.53 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1656  hypothetical protein  37.88 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000173023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5296  hypothetical protein  37.88 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4886  hypothetical protein  61.11 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.894999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1936  hypothetical protein  40.82 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1800  hypothetical protein  36.49 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.391971  normal  0.39195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1383  hypothetical protein  39.62 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>