33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0420 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0420  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  189  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1465  hypothetical protein  80.33 
 
 		 94 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0025  hypothetical protein  59.57 
 
 		 91 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.699949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0027  hypothetical protein  59.57 
 
 		 91 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0026  hypothetical protein  59.57 
 
 		 91 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834973  hitchhiker  0.00036673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5390  hypothetical protein  59.57 
 
 		 91 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0426586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1175  hypothetical protein  59.79 
 
 		 96 aa  93.6  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4518  hypothetical protein  72.58 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.292766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2342  hypothetical protein  67.21 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2194  hypothetical protein  64.62 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2714  hypothetical protein  64.06 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000197127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0447  hypothetical protein  53.23 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5296  hypothetical protein  53.03 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1656  hypothetical protein  53.03 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000173023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3869  hypothetical protein  46.15 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4143  hypothetical protein  41.98 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.256309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2230  hypothetical protein  43.06 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1254  hypothetical protein  65 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2276  hypothetical protein  57.78 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2711  hypothetical protein  44.26 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0128367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3971  hypothetical protein  48.15 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1936  hypothetical protein  54.72 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4886  hypothetical protein  55.88 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.894999 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4539  hypothetical protein  77.08 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6005  hypothetical protein  57.63 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1468  hypothetical protein  43.64 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1644  hypothetical protein  46.34 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3974  hypothetical protein  51.22 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.891922  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1073  hypothetical protein  42.31 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0073  hypothetical protein  42.67 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.49801 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1976  hypothetical protein  36.36 
 
 		 97 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000408088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1491  hypothetical protein  41.56 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1383  hypothetical protein  45.65 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>