28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2230 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2230  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0447  hypothetical protein  40.98 
 
 		 90 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3869  hypothetical protein  41.33 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1465  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2194  hypothetical protein  39.68 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4518  hypothetical protein  45.76 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.292766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2711  hypothetical protein  49.15 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0128367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1175  hypothetical protein  51.06 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2342  hypothetical protein  44.07 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5390  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0426586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0025  hypothetical protein  46 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.699949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0027  hypothetical protein  46 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0026  hypothetical protein  46 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834973  hitchhiker  0.00036673 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2714  hypothetical protein  37.5 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000197127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0420  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1644  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3974  hypothetical protein  55.32 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.891922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1468  hypothetical protein  47.27 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4143  hypothetical protein  45.45 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.256309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0031  copper-translocating P-type ATPase  61.76 
 
 		 838 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2276  hypothetical protein  46.67 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1936  hypothetical protein  41.51 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1073  hypothetical protein  55.1 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1383  hypothetical protein  53.66 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1976  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000408088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6005  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0265  hypothetical protein  64 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3419  hypothetical protein  64 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>