34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0447 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0447  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  184  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2342  hypothetical protein  70 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1465  hypothetical protein  60.94 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4518  hypothetical protein  53.93 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.292766  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5390  hypothetical protein  65.38 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0426586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0025  hypothetical protein  66 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.699949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0026  hypothetical protein  66 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834973  hitchhiker  0.00036673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0027  hypothetical protein  66 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1175  hypothetical protein  71.43 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2194  hypothetical protein  54.55 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2230  hypothetical protein  37.78 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0420  hypothetical protein  53.23 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2714  hypothetical protein  61.22 
 
 		 91 aa  66.6  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000197127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1656  hypothetical protein  53.62 
 
 		 83 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000173023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4143  hypothetical protein  43.24 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.256309 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5296  hypothetical protein  53.62 
 
 		 83 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3869  hypothetical protein  39.19 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2711  hypothetical protein  49.15 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0128367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3971  hypothetical protein  69.23 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1254  hypothetical protein  59.38 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1644  hypothetical protein  55 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2276  hypothetical protein  42.37 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1468  hypothetical protein  52.27 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1936  hypothetical protein  48 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3974  hypothetical protein  53.19 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.891922  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4539  hypothetical protein  54.41 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4886  hypothetical protein  59.46 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.894999 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6005  hypothetical protein  56.14 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1383  hypothetical protein  52.27 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0265  hypothetical protein  72 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3419  hypothetical protein  72 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1073  hypothetical protein  43.14 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1976  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000408088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1491  hypothetical protein  33.77 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>