31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1936 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1936  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  198  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4143  hypothetical protein  51.69 
 
 		 93 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.256309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1383  hypothetical protein  50.85 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3971  hypothetical protein  55.77 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5296  hypothetical protein  49.09 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1656  hypothetical protein  49.09 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000173023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0027  hypothetical protein  47.44 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0026  hypothetical protein  47.44 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834973  hitchhiker  0.00036673 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2194  hypothetical protein  47.27 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0025  hypothetical protein  47.44 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.699949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5390  hypothetical protein  46.84 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0426586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3869  hypothetical protein  48.98 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2230  hypothetical protein  38.16 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1175  hypothetical protein  54 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1465  hypothetical protein  52.94 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0420  hypothetical protein  51.02 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2342  hypothetical protein  52 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0447  hypothetical protein  48 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2714  hypothetical protein  43.68 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000197127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4518  hypothetical protein  57.14 
 
 		 92 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.292766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2276  hypothetical protein  52.38 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1073  hypothetical protein  38.46 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4886  hypothetical protein  45.45 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.894999 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2711  hypothetical protein  40.82 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0128367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1644  hypothetical protein  37.31 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129371 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1491  hypothetical protein  44.07 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3974  hypothetical protein  43.14 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.891922  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4836  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00815326  normal  0.0901781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1468  hypothetical protein  41.86 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6005  hypothetical protein  46.55 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1976  hypothetical protein  48.72 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000408088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>