27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0073 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009475  BBta_p0073  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.49801 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3869  hypothetical protein  50 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5296  hypothetical protein  55.36 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468297  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1656  hypothetical protein  55.36 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000173023  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6005  hypothetical protein  48.84 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850513  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2194  hypothetical protein  46.77 
 
 
98 aa  57  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3971  hypothetical protein  59.18 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4143  hypothetical protein  47.69 
 
 
93 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.256309 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0420  hypothetical protein  42.67 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4518  hypothetical protein  45.9 
 
 
92 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.292766  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1465  hypothetical protein  52.73 
 
 
94 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4886  hypothetical protein  60.87 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.894999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2342  hypothetical protein  44.44 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114019  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2714  hypothetical protein  45.9 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000197127  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0026  hypothetical protein  53.7 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834973  hitchhiker  0.00036673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0025  hypothetical protein  53.7 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.699949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5390  hypothetical protein  53.7 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0426586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0027  hypothetical protein  53.7 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882898  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1175  hypothetical protein  51.92 
 
 
96 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2276  hypothetical protein  63.89 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0447  hypothetical protein  47.83 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821045  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2230  hypothetical protein  44.44 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535182  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2711  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0128367  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1644  hypothetical protein  36.67 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.129371 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4836  hypothetical protein  50.68 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00815326  normal  0.0901781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1491  hypothetical protein  43.24 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1936  hypothetical protein  45.24 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578863  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>