19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1491 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1491  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  212  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3869  hypothetical protein  43.37 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4143  hypothetical protein  39.76 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.256309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2230  hypothetical protein  45.31 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5296  hypothetical protein  44.23 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1656  hypothetical protein  44.23 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000173023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1465  hypothetical protein  46.67 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2276  hypothetical protein  42.55 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1383  hypothetical protein  37.78 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3971  hypothetical protein  45.45 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0026  hypothetical protein  41.67 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834973  hitchhiker  0.00036673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0027  hypothetical protein  41.67 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0025  hypothetical protein  41.67 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.699949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5390  hypothetical protein  41.67 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0426586 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4518  hypothetical protein  48.98 
 
 		 92 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.292766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1936  hypothetical protein  43.24 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2342  hypothetical protein  46.67 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1175  hypothetical protein  44.23 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2194  hypothetical protein  43.1 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>