51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4797 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4797  PilT domain-containing protein  100 
 
 
128 aa  258  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165987  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4819  PilT domain-containing protein  78.91 
 
 
128 aa  209  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4577  PilT protein-like  58.59 
 
 
128 aa  144  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8285  PilT protein domain protein  58.59 
 
 
128 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394847  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1344  PilT protein-like  57.6 
 
 
132 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6313  PilT protein domain protein  45.31 
 
 
128 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10635  hypothetical protein  46.4 
 
 
131 aa  108  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000236971  normal  0.294663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0221  PilT domain-containing protein  41.6 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0052  PilT protein domain protein  42.31 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4476  PilT domain-containing protein  43.18 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187501  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3268  PilT domain-containing protein  39.84 
 
 
136 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207381  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3511  PilT domain-containing protein  39.84 
 
 
136 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.729818  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0313  PilT protein domain protein  39.84 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.179857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3454  PilT domain-containing protein  43.51 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12013  hypothetical protein  38.89 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4620  PilT protein domain protein  44.96 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2603  PilT protein domain protein  38.4 
 
 
127 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0526832  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0633  PilT domain-containing protein  40.6 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4793  PilT domain-containing protein  40.31 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0079864  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4706  PilT domain-containing protein  38.89 
 
 
127 aa  84.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.2127  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1171  PilT domain-containing protein  41.09 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22620  hypothetical protein  40 
 
 
131 aa  83.6  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02550  hypothetical protein  41.54 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4717  PilT domain-containing protein  40.8 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5903  PilT domain-containing protein  36.51 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5502  PilT protein-like protein  36.51 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.835237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12772  hypothetical protein  37.98 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3171  PilT domain-containing protein  37.21 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231716  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1130  PilT domain-containing protein  39.39 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.276422 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0004  PilT domain-containing protein  42.11 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0705  PilT protein domain protein  36 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274401  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0945  PilT domain-containing protein  37.21 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5554  PilT protein domain protein  40.31 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49737  normal  0.0291692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1379  PilT protein domain protein  41.09 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.293782  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1445  PilT protein-like  40 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5432  PilT domain-containing protein  36.8 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.373074  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4668  PilT domain-containing protein  39.2 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.52306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1406  PilT protein domain protein  34.85 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.116397 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0736  PilT domain-containing protein  32.82 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395482  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10620  hypothetical protein  40.31 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00795839  normal  0.407097 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0291  hypothetical protein  38.17 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0702  PilT protein domain protein  35.38 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2859  PilT domain-containing protein  38.79 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.528221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2424  PilT protein domain protein  41.73 
 
 
132 aa  67  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1871  PilT domain-containing protein  37.31 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.520995  normal  0.175197 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3708  PilT domain-containing protein  32.06 
 
 
132 aa  63.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4604  PilT domain-containing protein  33.57 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3944  PilT protein  37.5 
 
 
123 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00101332  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9882  hypothetical protein  29.08 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4432  hypothetical protein  37.68 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818322  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4325  PilT protein-like  29.32 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.287543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>