51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3708 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3708  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 132 aa  268  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1871  PilT domain-containing protein  58.46 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.520995  normal  0.175197 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0291  hypothetical protein  56.15 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3511  PilT domain-containing protein  46.56 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.729818  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3268  PilT domain-containing protein  46.56 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1406  PilT protein domain protein  44.96 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.116397 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4793  PilT domain-containing protein  40.77 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0079864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1130  PilT domain-containing protein  47.29 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276422 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4604  PilT domain-containing protein  41.26 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5554  PilT protein domain protein  41.54 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49737  normal  0.0291692 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0702  PilT protein domain protein  41.86 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1379  PilT protein domain protein  39.23 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.293782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0004  PilT domain-containing protein  42.64 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4325  PilT protein-like  38.35 
 
 		 134 aa  90.5  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.287543  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9882  hypothetical protein  36.88 
 
 		 144 aa  85.9  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4577  PilT protein-like  38.17 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1171  PilT domain-containing protein  36.5 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3454  PilT domain-containing protein  35.61 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5432  PilT domain-containing protein  39.53 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.373074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4476  PilT domain-containing protein  36.43 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12772  hypothetical protein  35.38 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8285  PilT protein domain protein  36.92 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394847  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0633  PilT domain-containing protein  35.11 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10635  hypothetical protein  37.21 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000236971  normal  0.294663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22620  hypothetical protein  33.83 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4620  PilT protein domain protein  30.23 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1445  PilT protein-like  29.46 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1344  PilT protein-like  38.35 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4432  hypothetical protein  43.42 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818322  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0313  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.179857 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02550  hypothetical protein  33.08 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0052  PilT protein domain protein  37.04 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4717  PilT domain-containing protein  44.87 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4706  PilT domain-containing protein  31.5 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.2127  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0705  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274401  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4797  PilT domain-containing protein  32.06 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2603  PilT protein domain protein  32.56 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0526832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6313  PilT protein domain protein  34.88 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0221  PilT domain-containing protein  31.78 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0945  PilT domain-containing protein  31.54 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4819  PilT domain-containing protein  32.58 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10620  hypothetical protein  32.37 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00795839  normal  0.407097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4668  PilT domain-containing protein  43.66 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.52306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2424  PilT protein domain protein  35.38 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0736  PilT domain-containing protein  31.54 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395482  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3171  PilT domain-containing protein  29.13 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231716  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2859  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.528221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12013  hypothetical protein  33.59 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3944  PilT protein  25.2 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00101332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5903  PilT domain-containing protein  28.24 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5502  PilT protein-like protein  28.24 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.835237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>