53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6313 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6313  PilT protein domain protein  100 
 
 		 128 aa  262  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4577  PilT protein-like  53.12 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8285  PilT protein domain protein  54.69 
 
 		 128 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394847  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0052  PilT protein domain protein  50 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10635  hypothetical protein  45.6 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000236971  normal  0.294663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1171  PilT domain-containing protein  44.96 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4620  PilT protein domain protein  49.61 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4797  PilT domain-containing protein  45.31 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0313  PilT protein domain protein  42.97 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.179857 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02550  hypothetical protein  46.51 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1445  PilT protein-like  47.29 
 
 		 133 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10620  hypothetical protein  46.51 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00795839  normal  0.407097 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4819  PilT domain-containing protein  42.19 
 
 		 128 aa  103  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12772  hypothetical protein  41.09 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4476  PilT domain-containing protein  46.15 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1344  PilT protein-like  47.2 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3454  PilT domain-containing protein  43.41 
 
 		 132 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22620  hypothetical protein  41.09 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0221  PilT domain-containing protein  39.2 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0633  PilT domain-containing protein  41.04 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12013  hypothetical protein  38.89 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5432  PilT domain-containing protein  37.9 
 
 		 133 aa  87.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.373074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3944  PilT protein  41.8 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00101332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4717  PilT domain-containing protein  42.64 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5554  PilT protein domain protein  40.91 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49737  normal  0.0291692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1871  PilT domain-containing protein  43.51 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.520995  normal  0.175197 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4793  PilT domain-containing protein  38.64 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0079864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3268  PilT domain-containing protein  38.17 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207381  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3511  PilT domain-containing protein  38.17 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.729818  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0705  PilT protein domain protein  36 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274401  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1130  PilT domain-containing protein  40.46 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276422 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0291  hypothetical protein  39.69 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0736  PilT domain-containing protein  38.1 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395482  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0945  PilT domain-containing protein  38.76 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5502  PilT protein-like protein  36.51 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.835237 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5903  PilT domain-containing protein  36.51 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3171  PilT domain-containing protein  37.4 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231716  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4706  PilT domain-containing protein  35.71 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.2127  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0004  PilT domain-containing protein  39.85 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2603  PilT protein domain protein  36.51 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0526832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2859  PilT domain-containing protein  38.66 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.528221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1379  PilT protein domain protein  40.31 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.293782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1406  PilT protein domain protein  39.55 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.116397 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0702  PilT protein domain protein  37.01 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2424  PilT protein domain protein  38.17 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4668  PilT domain-containing protein  36.59 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.52306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4432  hypothetical protein  62.79 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818322  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3708  PilT domain-containing protein  34.88 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4325  PilT protein-like  33.33 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.287543  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11759  hypothetical protein  31.5 
 
 		 82 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0382408 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4604  PilT domain-containing protein  60.53 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9882  hypothetical protein  30.14 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0584  PilT protein-like  27.2 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>