52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2603 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2603  PilT protein domain protein  100 
 
 		 127 aa  254  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0526832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4706  PilT domain-containing protein  71.65 
 
 		 127 aa  191  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.2127  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3171  PilT domain-containing protein  73.23 
 
 		 127 aa  188  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231716  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4668  PilT domain-containing protein  75.2 
 
 		 130 aa  160  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.52306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0736  PilT domain-containing protein  57.14 
 
 		 126 aa  154  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395482  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4476  PilT domain-containing protein  43.75 
 
 		 131 aa  94.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3454  PilT domain-containing protein  46.21 
 
 		 132 aa  94.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02550  hypothetical protein  40.94 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1130  PilT domain-containing protein  43.08 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276422 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12772  hypothetical protein  41.73 
 
 		 131 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0052  PilT protein domain protein  43.85 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4577  PilT protein-like  41.41 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3511  PilT domain-containing protein  39.1 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.729818  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4797  PilT domain-containing protein  38.4 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3268  PilT domain-containing protein  39.1 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207381  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4604  PilT domain-containing protein  41.13 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10635  hypothetical protein  41.6 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000236971  normal  0.294663 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5432  PilT domain-containing protein  38.58 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.373074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8285  PilT protein domain protein  43.75 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394847  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1871  PilT domain-containing protein  43.41 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.520995  normal  0.175197 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0313  PilT protein domain protein  40.62 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.179857 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0291  hypothetical protein  40.15 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1406  PilT protein domain protein  41.54 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.116397 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12013  hypothetical protein  40.8 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1379  PilT protein domain protein  39.23 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.293782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4819  PilT domain-containing protein  36.72 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0633  PilT domain-containing protein  37.04 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0221  PilT domain-containing protein  36.51 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4717  PilT domain-containing protein  38.58 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1344  PilT protein-like  43.65 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6313  PilT protein domain protein  36.51 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1445  PilT protein-like  39.23 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0004  PilT domain-containing protein  43.51 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0705  PilT protein domain protein  34.43 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274401  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4620  PilT protein domain protein  37.12 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0702  PilT protein domain protein  41.67 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22620  hypothetical protein  37.1 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5554  PilT protein domain protein  38.17 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49737  normal  0.0291692 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5502  PilT protein-like protein  37.3 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.835237 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5903  PilT domain-containing protein  37.3 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1171  PilT domain-containing protein  38.93 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4793  PilT domain-containing protein  32.33 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0079864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2424  PilT protein domain protein  38.64 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4432  hypothetical protein  43.24 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818322  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0945  PilT domain-containing protein  37.4 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3708  PilT domain-containing protein  32.56 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2859  PilT domain-containing protein  35.83 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.528221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10620  hypothetical protein  35.94 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00795839  normal  0.407097 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9882  hypothetical protein  29.45 
 
 		 144 aa  52  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4325  PilT protein-like  26.92 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.287543  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3944  PilT protein  31.53 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00101332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0453  PilT protein domain protein  21.26 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>