2838 genes were found for organism Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 29    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bcenmc03_3185  CDS  NC_010515  29  481  -  453  hypothetical protein  YP_001776832  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3186    NC_010515  478  636  -  159      normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3187  CDS  NC_010515  723  2003  -  1281  transposase mutator type  YP_001776833  normal  0.361508  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3188  CDS  NC_010515  2651  3361  +  711  GntR family transcriptional regulator  YP_001776834  normal  0.804639  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3189  CDS  NC_010515  3435  4241  +  807  short chain dehydrogenase  YP_001776835  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3190  CDS  NC_010515  4277  5209  +  933  hypothetical protein  YP_001776836  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3191  CDS  NC_010515  5433  6761  +  1329  major facilitator transporter  YP_001776837  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3192  CDS  NC_010515  6921  8186  -  1266  chloride channel core  YP_001776838  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3193  CDS  NC_010515  8415  9656  -  1242  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  YP_001776839  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3194  CDS  NC_010515  9997  11139  +  1143  porin  YP_001776840  normal  0.809666  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3195  CDS  NC_010515  11362  11664  +  303  hypothetical protein  YP_001776841  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3196  CDS  NC_010515  11775  12722  -  948  LysR family transcriptional regulator  YP_001776842  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3197  CDS  NC_010515  12922  15105  +  2184  fusaric acid resistance protein region  YP_001776843  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3198  CDS  NC_010515  15243  15455  +  213  hypothetical protein  YP_001776844  normal  0.755044  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3199  CDS  NC_010515  15603  16712  -  1110  peptidase S58 DmpA  YP_001776845  normal  0.448482  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3200  CDS  NC_010515  16773  18179  -  1407  amino acid permease-associated region  YP_001776846  normal  0.274906  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3201  CDS  NC_010515  18312  19112  +  801  LuxR family transcriptional regulator  YP_001776847  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3202  CDS  NC_010515  19413  19787  +  375  hypothetical protein  YP_001776848  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3203  CDS  NC_010515  19916  21433  -  1518  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  YP_001776849  normal  0.525066  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3204  CDS  NC_010515  21483  22838  -  1356  beta alanine--pyruvate transaminase  YP_001776850  normal  0.141001  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3205  CDS  NC_010515  22944  23894  +  951  LysR family transcriptional regulator  YP_001776851  normal  0.241885  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3206  CDS  NC_010515  23919  25160  -  1242  major facilitator transporter  YP_001776852  normal  0.130501  normal  0.812744  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3207  CDS  NC_010515  25157  25492  -  336  hypothetical protein  YP_001776853  normal  0.147352  normal  0.677616  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3208  CDS  NC_010515  25530  26018  -  489  MarR family transcriptional regulator  YP_001776854  normal  0.12726  normal  0.713181  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3209  CDS  NC_010515  26169  26660  +  492  cupin 2 domain-containing protein  YP_001776855  normal  0.179225  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3210  CDS  NC_010515  26766  27914  -  1149  epocide hydrolase domain-containing protein  YP_001776856  normal  0.257552  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3211  CDS  NC_010515  27993  28958  -  966  AraC family transcriptional regulator  YP_001776857  normal  0.119122  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3212  CDS  NC_010515  29101  29901  +  801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001776858  normal  0.177624  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3213  CDS  NC_010515  29898  31247  -  1350  major facilitator transporter  YP_001776859  normal  0.0529349  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3214  CDS  NC_010515  31342  32694  -  1353  major facilitator transporter  YP_001776860  normal  0.0924925  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3215  CDS  NC_010515  32881  33840  -  960  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001776861  normal  0.906038  normal  0.814855  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3216  CDS  NC_010515  34019  35662  +  1644  IclR family transcriptional regulator  YP_001776862  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3217  CDS  NC_010515  36479  36961  -  483  AsnC family transcriptional regulator  YP_001776863  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3218  CDS  NC_010515  37246  37899  +  654  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_001776864  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3219  CDS  NC_010515  38022  39197  +  1176  voltage-gated potassium channel  YP_001776865  normal  1  normal  0.630222  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3220  CDS  NC_010515  39259  39690  +  432  membrane protein-like protein  YP_001776866  normal  1  normal  0.55153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3221  CDS  NC_010515  39830  41812  +  1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001776867  normal  1  normal  0.229974  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3222  CDS  NC_010515  41855  43507  -  1653  acyl-CoA synthetase  YP_001776868  normal  0.831142  normal  0.141843  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3223  CDS  NC_010515  43676  44419  +  744  cyclic nucleotide-binding protein  YP_001776869  normal  1  normal  0.319468  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3224  CDS  NC_010515  44604  47771  +  3168  acriflavin resistance protein  YP_001776870  normal  1  normal  0.292287  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3225  CDS  NC_010515  47859  49037  +  1179  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_001776871  normal  0.376119  normal  0.122741  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3226  CDS  NC_010515  49043  50554  +  1512  RND efflux system outer membrane lipoprotein  YP_001776872  normal  0.303935  normal  0.0862047  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3227  CDS  NC_010515  50588  51283  +  696  two component heavy metal response transcriptional regulator  YP_001776873  normal  0.303749  normal  0.0627816  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3228  CDS  NC_010515  51280  52764  +  1485  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  YP_001776874  normal  0.8274  normal  0.13211  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3229  CDS  NC_010515  52841  53881  -  1041  AraC family transcriptional regulator  YP_001776875  normal  0.0808896  normal  0.115226  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3230  CDS  NC_010515  54026  55552  -  1527  amidase  YP_001776876  normal  0.486122  normal  0.21253  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3231  CDS  NC_010515  55608  56666  -  1059  phenylacetaldoxime dehydratase  YP_001776877  normal  0.470184  normal  0.481728  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3232  CDS  NC_010515  56763  57656  -  894  hypothetical protein  YP_001776878  normal  0.389417  normal  0.383811  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3233  CDS  NC_010515  58172  58771  +  600  nitrile hydratase, alpha subunit  YP_001776879  normal  1  normal  0.609067  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3234  CDS  NC_010515  58816  59469  +  654  nitrile hydratase  YP_001776880  normal  1  normal  0.586859  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3235  CDS  NC_010515  59466  60728  +  1263  cobalamin synthesis protein P47K  YP_001776881  normal  1  normal  0.673339  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3236  CDS  NC_010515  60916  61503  +  588  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_001776882  normal  1  normal  0.748057  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3237  CDS  NC_010515  61516  62361  -  846  AraC family transcriptional regulator  YP_001776883  normal  1  normal  0.601996  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3238  CDS  NC_010515  62621  63178  -  558  hypothetical protein  YP_001776884  normal  1  normal  0.454233  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3239  CDS  NC_010515  63533  64087  +  555  hypothetical protein  YP_001776885  normal  0.697962  normal  0.454233  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3240  CDS  NC_010515  64208  64762  +  555  hypothetical protein  YP_001776886  normal  1  normal  0.456949  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3241  CDS  NC_010515  65160  65954  +  795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001776887  normal  1  normal  0.804002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3242  CDS  NC_010515  65995  66369  -  375  hypothetical protein  YP_001776888  normal  0.819475  normal  0.751832  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3243  CDS  NC_010515  66591  67661  -  1071  hypothetical protein  YP_001776889  normal  0.340258  normal  0.654322  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3244  CDS  NC_010515  67799  68908  -  1110  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_001776890  normal  0.324542  normal  0.664985  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3245  CDS  NC_010515  69050  69736  -  687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  YP_001776891  normal  0.433904  normal  0.585476  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3246  CDS  NC_010515  70094  71122  -  1029  LacI family transcription regulator  YP_001776892  normal  0.759172  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3247  CDS  NC_010515  71310  72893  +  1584  levansucrase  YP_001776893  normal  0.36332  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3248  CDS  NC_010515  73069  74706  +  1638  levanase  YP_001776894  normal  0.155221  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3249  CDS  NC_010515  74775  75524  -  750  short chain dehydrogenase  YP_001776895  normal  0.116631  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3250  CDS  NC_010515  75647  76564  -  918  MarR family transcriptional regulator  YP_001776896  normal  0.99864  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3251  CDS  NC_010515  76730  78214  +  1485  transcriptional regulator  YP_001776897  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3252  CDS  NC_010515  78311  78748  +  438  alkylhydroperoxidase  YP_001776898  normal  0.654537  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3253  CDS  NC_010515  78759  79178  +  420  cupin 2 domain-containing protein  YP_001776899  normal  0.641495  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3254  CDS  NC_010515  79276  80496  -  1221  porin  YP_001776900  normal  0.238701  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3255  CDS  NC_010515  80977  82044  -  1068  squalene/phytoene synthase  YP_001776901  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3256  CDS  NC_010515  82428  83573  +  1146  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  YP_001776902  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3257  CDS  NC_010515  83644  85269  -  1626  rhodanese domain-containing protein  YP_001776903  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3258  CDS  NC_010515  85375  85941  -  567  cysteine dioxygenase type I  YP_001776904  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3259  CDS  NC_010515  86016  86939  +  924  LysR family transcriptional regulator  YP_001776905  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3260  CDS  NC_010515  87028  88407  -  1380  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_001776906  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3261  CDS  NC_010515  88654  89739  +  1086  alkanesulfonate monooxygenase  YP_001776907  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3262  CDS  NC_010515  89772  90611  +  840  hypothetical protein  YP_001776908  normal  0.976014  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3263  CDS  NC_010515  90643  91677  +  1035  NMT1/THI5-like domain-containing protein  YP_001776909  normal  0.0622389  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3264  CDS  NC_010515  91682  92779  +  1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001776910  normal  0.657095  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3265  CDS  NC_010515  92773  93594  +  822  ABC transporter related  YP_001776911  normal  0.745893  normal  0.952951  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3266  CDS  NC_010515  93645  94829  +  1185  cytochrome c class I  YP_001776912  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3267  CDS  NC_010515  94863  95816  +  954  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  YP_001776913  normal  1  normal  0.731397  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3268  CDS  NC_010515  95912  96778  +  867  MOSC domain-containing protein  YP_001776914  normal  1  normal  0.545549  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3269  CDS  NC_010515  96834  98258  -  1425  histidine kinase  YP_001776915  normal  0.86332  normal  0.63748  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3270  CDS  NC_010515  98255  98929  -  675  two component transcriptional regulator  YP_001776916  normal  0.424776  normal  0.538433  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3271  CDS  NC_010515  99036  100271  -  1236  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  YP_001776917  normal  1  normal  0.638949  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3272  CDS  NC_010515  100373  101854  +  1482  transcriptional regulator  YP_001776918  normal  1  normal  0.831292  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3273  CDS  NC_010515  102048  103148  +  1101  extracellular solute-binding protein  YP_001776919  normal  0.281784  normal  0.946498  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3274  CDS  NC_010515  103257  105029  +  1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001776920  normal  0.312998  normal  0.625588  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3275  CDS  NC_010515  105022  106089  +  1068  ABC transporter related  YP_001776921  normal  0.0100631  normal  0.197934  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3276  CDS  NC_010515  106241  107332  +  1092  porin  YP_001776922  normal  0.0390165  normal  0.139851  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3277  CDS  NC_010515  107477  108439  -  963  alcohol dehydrogenase  YP_001776923  normal  0.0100631  normal  0.124844  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3278  CDS  NC_010515  108472  108723  -  252  hypothetical protein  YP_001776924  hitchhiker  0.00180181  normal  0.0675674  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3279  CDS  NC_010515  108819  109610  +  792  AraC family transcriptional regulator  YP_001776925  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3280  CDS  NC_010515  109686  110492  -  807  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  YP_001776926  normal  0.0265023  normal  0.125744  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3281  CDS  NC_010515  110505  111308  -  804  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  YP_001776927  normal  0.0269586  normal  0.185525  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3282  CDS  NC_010515  111329  111721  -  393  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate isomerase  YP_001776928  normal  0.0116683  normal  0.241616  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3283  CDS  NC_010515  111766  112614  -  849  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  YP_001776929  normal  0.225438  normal  0.128816  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3284  CDS  NC_010515  112661  114124  -  1464  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  YP_001776930  normal  0.0847385  normal  0.0581994  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 29    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>